RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495953.2

RAPGEF3-215, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene RAPGEF3, Length 648 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3-215ENST00000495953 NDUFA1O15239 70 aa10.04□□□□□ -0.8
RAPGEF3-215ENST00000495953 SLPIP03973 132 aa10.04□□□□□ -0.8
RAPGEF3-215ENST00000495953 HERVK_113P61574 105 aa10.04□□□□□ -0.8
RAPGEF3-215ENST00000495953 RNF151Q2KHN1 245 aa10.04□□□□□ -0.8
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RAPGEF3-215ENST00000495953 LRP1BQ9NZR2 4599 aa10.04□□□□□ -0.8
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RAPGEF3-215ENST00000495953 SFTA2Q6UW10 78 aa10.03□□□□□ -0.8
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RAPGEF3-215ENST00000495953 C16orf90A8MZG2 172 aa10□□□□□ -0.81
RAPGEF3-215ENST00000495953 PLEKHB2Q96CS7 222 aa10□□□□□ -0.81
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RAPGEF3-215ENST00000495953 LINC01620Q4KN68 170 aa9.94□□□□□ -0.82
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RAPGEF3-215ENST00000495953 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RAPGEF3-215ENST00000495953 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.94□□□□□ -0.82
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RAPGEF3-215ENST00000495953 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.93□□□□□ -0.82
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RAPGEF3-215ENST00000495953 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RAPGEF3-215ENST00000495953 PCP2Q8IVA1 136 aa9.8□□□□□ -0.84
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RAPGEF3-215ENST00000495953 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.8□□□□□ -0.84
RAPGEF3-215ENST00000495953 EPM2AB3EWF7 344 aa9.79□□□□□ -0.84
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RAPGEF3-215ENST00000495953 SCXQ7RTU7 201 aa9.79□□□□□ -0.84
RAPGEF3-215ENST00000495953 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.79□□□□□ -0.84
RAPGEF3-215ENST00000495953 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.79□□□□□ -0.84
RAPGEF3-215ENST00000495953 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.79□□□□□ -0.84
RAPGEF3-215ENST00000495953 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.79□□□□□ -0.84
RAPGEF3-215ENST00000495953 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.79□□□□□ -0.84
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RAPGEF3-215ENST00000495953 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa9.77□□□□□ -0.85
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