RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495311.1

POLR2B-210, Transcript of RNA polymerase II subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR2B, Length 541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2B-210ENST00000495311 GCSHP23434 173 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 S100A2P29034 98 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 SPAG11BQ08648 103 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 TMEM223A0PJW6 202 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 IGKCP01834 107 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 AKR1D1P51857 326 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 SYCNQ0VAF6 134 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 C16orf90A8MZG2 172 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 CXCL5P42830 114 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 H0Y8G0 127 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 NDUFA1O15239 70 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 PRSS2P07478 247 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 SPINK8P0C7L1 97 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 Q6ZRU5 148 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 Q6ZSA8 131 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 Q8N1X5 172 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 COX7B2Q8TF08 81 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 CARD19Q96LW7 228 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 KRTAP10-1P60331 282 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 KRTDAPP60985 99 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
POLR2B-210ENST00000495311 C20orf202A1L168 122 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 CKS1BP61024 79 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 C10orf25Q5T742 122 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 SFTA2Q6UW10 78 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 C2orf82Q6UX34 121 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 E9PLD3 99 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 LEPROTO15243 131 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 HERVK_113P61574 105 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 LINC01620Q4KN68 170 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 EPM2AB3EWF7 344 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 J3QQQ9 107 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 NMUP48645 174 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 HERV-K104P63124 156 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 COX17Q14061 63 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 PTTG1IPP53801 180 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 XGP55808 180 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 STPG4Q8N801 248 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR2B-210ENST00000495311 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 LINC00587B1AMM8 73 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 Q6ZRP5 223 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 A0A096LNI7 61 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 PANO1I0J062 215 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 ERG28Q9UKR5 140 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 SCGB1D1O95968 90 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 ATOH7Q8N100 152 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 A0A087WYN8 130 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 CHTF8P0CG12 524 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 GAGE2BQ13066 116 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 SCXQ7RTU7 201 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 MAJINQ3KP22 176 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR2B-210ENST00000495311 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR2B-210ENST00000495311 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR2B-210ENST00000495311 A0A0J9YXY3 114 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR2B-210ENST00000495311 A0A1W2PNN7 141 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR2B-210ENST00000495311 TIMM17BO60830 172 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR2B-210ENST00000495311 PFN2P35080 140 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR2B-210ENST00000495311 GAGE2EQ4V326 116 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR2B-210ENST00000495311 PYY3Q5JQD4 70 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR2B-210ENST00000495311 DPH3Q96FX2 82 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR2B-210ENST00000495311 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.07□□□□□ -1.28
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