RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293		A0A0J9YY99	117 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293		I3L3M4	83 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293		K7ERJ3	54 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293		M0R2P5	195 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	PSMB2	P49721	201 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	FXYD2	P54710	66 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293		Q1RN00	199 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	BAALC	Q8WXS3	180 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	TIMM17A	Q99595	171 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	SIGMAR1	Q99720	223 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	TENM2	Q9NT68	2774 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293		A0A1B0GWB2	263 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM238	C9JI98	176 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293		H3BNG1	76 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	RS1	O15537	224 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	APOM	O95445	188 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	IGHV3-53	P01767	116 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	COX6C	P09669	75 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293		Q6ZQT7	251 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	COPS9	Q8WXC6	57 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	PRO0255	Q9UI72	69 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	C11orf86	A6NJI1	115 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293		A8MWV9	139 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293		H3BMG7	143 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293		J3QQQ9	107 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	LEPROT	O15243	131 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	SCGB1A1	P11684	91 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	MTURN	Q8N3F0	131 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	ERG28	Q9UKR5	140 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-240	ENST00000495293	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	IGIP	A6NJ69	53 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293		M0R2N4	97 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	CRYBA4	P53673	196 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	PTH2	Q96A98	100 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	C9orf85	Q96MD7	179 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293		A0A096LPF7	62 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293		A0A1B0GV72	72 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM262	E9PQX1	116 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	DSCR10	P59022	87 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	WFDC2	Q14508	124 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	ATXN8	Q156A1	80 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	TTC32	Q5I0X7	151 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	RYR3	Q15413	4870 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293		H7C2G1	150 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293		H7C423	109 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293		M0QY20	66 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	UBE2L6	O14933	153 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	ESRG	Q1W209	222 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-240	ENST00000495293	ETDB	Q3ZM63	59 aa		3.06	□□□□□ -1.92

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