RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494332.5

PRRT1-209, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PRRT1, Length 493 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-209ENST00000494332 COX7B2Q8TF08 81 aa7.47□□□□□ -1.21
PRRT1-209ENST00000494332 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.47□□□□□ -1.21
PRRT1-209ENST00000494332 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PRRT1-209ENST00000494332 GCSHP23434 173 aa7.46□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 RNF151Q2KHN1 245 aa7.46□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 Q6ZRU5 148 aa7.46□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.46□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.45□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.44□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 KRTAP10-1P60331 282 aa7.44□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 HERVK_113P61574 105 aa7.44□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.44□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 C10orf25Q5T742 122 aa7.44□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 C2orf82Q6UX34 121 aa7.44□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.44□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.44□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 RYR1P21817 5038 aa7.44□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 CKS1BP61024 79 aa7.43□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 SFTA2Q6UW10 78 aa7.43□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 LEPROTO15243 131 aa7.42□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 LINC01620Q4KN68 170 aa7.42□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.42□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 Q6ZSA8 131 aa7.42□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.42□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 E9PLD3 99 aa7.41□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.41□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.41□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.4□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PRRT1-209ENST00000494332 J3QQQ9 107 aa7.39□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 NMUP48645 174 aa7.39□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.39□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 A0A096LNI7 61 aa7.38□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.38□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 PTTG1IPP53801 180 aa7.38□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 ATOH7Q8N100 152 aa7.38□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 STPG4Q8N801 248 aa7.38□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.38□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.38□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 CDK2AP2O75956 126 aa7.37□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 SCGB1D1O95968 90 aa7.37□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 HERV-K104P63124 156 aa7.37□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.37□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.37□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 HSPG2P98160 4391 aa7.37□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.36□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.36□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 PANO1I0J062 215 aa7.36□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 CHTF8P0CG12 524 aa7.36□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 Q6ZRP5 223 aa7.36□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.36□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 ERG28Q9UKR5 140 aa7.36□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 COX17Q14061 63 aa7.35□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 HERC2O95714 4834 aa7.35□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.34□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 GAGE2BQ13066 116 aa7.34□□□□□ -1.23
PRRT1-209ENST00000494332 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.33□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 XGP55808 180 aa7.33□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 MAJINQ3KP22 176 aa7.33□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 SCXQ7RTU7 201 aa7.33□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 LINC00587B1AMM8 73 aa7.32□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 EPM2AB3EWF7 344 aa7.32□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 GAGE2EQ4V326 116 aa7.32□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 PYY3Q5JQD4 70 aa7.32□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.32□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.32□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 A0A087WYN8 130 aa7.31□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 A0A0J9YXY3 114 aa7.31□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 ZNF815PA8K554 130 aa7.31□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 PFN2P35080 140 aa7.31□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.31□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.31□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.31□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 TIMM17BO60830 172 aa7.3□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 SMIM13P0DJ93 91 aa7.3□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 FAT1Q14517 4588 aa7.29□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 LINC00158P58513 81 aa7.29□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 HAMPP81172 84 aa7.29□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 PCP2Q8IVA1 136 aa7.29□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 VAMP8Q9BV40 100 aa7.29□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.29□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.29□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.28□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 LITAFQ99732 161 aa7.28□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.28□□□□□ -1.24
PRRT1-209ENST00000494332 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.27□□□□□ -1.25
PRRT1-209ENST00000494332 A0A1W2PNN7 141 aa7.27□□□□□ -1.25
PRRT1-209ENST00000494332 FAM168BA1KXE4 195 aa7.27□□□□□ -1.25
PRRT1-209ENST00000494332 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.27□□□□□ -1.25
PRRT1-209ENST00000494332 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.26□□□□□ -1.25
PRRT1-209ENST00000494332 A0A0U1RRA0 63 aa7.26□□□□□ -1.25
PRRT1-209ENST00000494332 COX8AP10176 69 aa7.26□□□□□ -1.25
PRRT1-209ENST00000494332 SPATA45Q537H7 98 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms