RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 FHL3Q13643 280 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 REG3GQ6UW15 175 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 C10orf25Q5T742 122 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 C3orf22Q8N5N4 141 aa12.06□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 SPTBN4Q9H254 2564 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 SPINK6Q6UWN8 80 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 Q8N814 137 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 NDUFC1O43677 76 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 FAM19A4Q96LR4 140 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 ZNF462Q96JM2 2506 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 Q6JHZ5 121 aa12.02□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 SERP2Q8N6R1 65 aa12.02□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 CHD8Q9HCK8 2581 aa12.02□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa12.02□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 FAM236CP0DP71 79 aa12.02□□□□□ -0.48
NISCH-213ENST00000489895 C1orf134Q5TEV5 83 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-213ENST00000489895 LINC01546A6NGU7 62 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-213ENST00000489895 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-213ENST00000489895 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-213ENST00000489895 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
NISCH-213ENST00000489895 HRCT1Q6UXD1 115 aa12□□□□□ -0.49
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NISCH-213ENST00000489895 C1orf137Q5JT78 98 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-213ENST00000489895 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
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NISCH-213ENST00000489895 H3BNG1 76 aa11.96□□□□□ -0.5
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NISCH-213ENST00000489895 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
NISCH-213ENST00000489895 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa11.9□□□□□ -0.51
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-213ENST00000489895 V9GYY9 64 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-213ENST00000489895 PTPRBP23467 1997 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-213ENST00000489895 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-213ENST00000489895 X6R8D5 127 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-213ENST00000489895 Q8N9L7 120 aa11.87□□□□□ -0.51
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NISCH-213ENST00000489895 PCSK5Q92824 1860 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-213ENST00000489895 FASNP49327 2511 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-213ENST00000489895 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa11.84□□□□□ -0.51
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NISCH-213ENST00000489895 LINC00337Q8N6G1 96 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-213ENST00000489895 C22orf24Q9Y442 160 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-213ENST00000489895 MTORP42345 2549 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-213ENST00000489895 PKD1L2Q7Z442 2459 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-213ENST00000489895 K7ERS5 55 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-213ENST00000489895 BRK1Q8WUW1 75 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-213ENST00000489895 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-213ENST00000489895 MPLKIPQ8TAP9 179 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-213ENST00000489895 FAM30AQ9NZY2 134 aa11.79□□□□□ -0.52
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
NISCH-213ENST00000489895 SPTSSBQ8NFR3 76 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-213ENST00000489895 Q8NAQ8 132 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-213ENST00000489895 A0A087WSZ3 146 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-213ENST00000489895 SMCR5Q8TEV8 140 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-213ENST00000489895 CCDC179H3BU77 68 aa11.74□□□□□ -0.53
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NISCH-213ENST00000489895 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-213ENST00000489895 PRLHP81277 87 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-213ENST00000489895 SERP1Q9Y6X1 66 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-213ENST00000489895 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-213ENST00000489895 Q8N3U1 123 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-213ENST00000489895 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-213ENST00000489895 A8MTW9 85 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-213ENST00000489895 POLQO75417 2590 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZVQ6 151 aa11.71□□□□□ -0.54
NISCH-213ENST00000489895 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
NISCH-213ENST00000489895 LINC00208Q96KT6 92 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-213ENST00000489895 A0A087WVE0 104 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-213ENST00000489895 LINC00167Q96N53 147 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-213ENST00000489895 A0A096LNT2 108 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-213ENST00000489895 PRR4Q16378 134 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-213ENST00000489895 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-213ENST00000489895 LINC00846Q9NV44 126 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-213ENST00000489895 CXCL6P80162 114 aa11.67□□□□□ -0.54
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