RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488013.1

HDLBP-242, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 651 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-242ENST00000488013 HERV-K104P63124 156 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 A0A087WTM6 91 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 NDUFA1O15239 70 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 C15orf56Q8N910 161 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 KIAA0087Q14695 138 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 GCSHP23434 173 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 RNF151Q2KHN1 245 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 SPATA45Q537H7 98 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 Q8N814 137 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 RTL8CO15255 209 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 DLEU1O43261 78 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 SYCNQ0VAF6 134 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 KMT2AQ03164 3969 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 ZNF815PA8K554 130 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 LECT2O14960 151 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 COX8AP10176 69 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 COX17Q14061 63 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 CARD19Q96LW7 228 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 MAJINQ3KP22 176 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 XP32Q5T750 250 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 C12orf57Q99622 126 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 TIMM17BO60830 172 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-242ENST00000488013 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 WFDC2Q14508 124 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 C2orf82Q6UX34 121 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 Q6ZVH6 145 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 COPS9Q8WXC6 57 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 DNAH2Q9P225 4427 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 RYR2Q92736 4967 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 TSTD3H0UI37 97 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 Q6ZRU5 148 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 PCP2Q8IVA1 136 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 ERG28Q9UKR5 140 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 A0A0J9YXY3 114 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 TMEM238C9JI98 176 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 C14orf144Q96I85 54 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 LINC00158P58513 81 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 SLPIP03973 132 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 C10orf25Q5T742 122 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 HIGD1BQ9P298 99 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 RYR1P21817 5038 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 IFITM1P13164 125 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 PFN2P35080 140 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-242ENST00000488013 C16orf90A8MZG2 172 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-242ENST00000488013 SMIM13P0DJ93 91 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-242ENST00000488013 PTTG1IPP53801 180 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-242ENST00000488013 TAL2Q16559 108 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-242ENST00000488013 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-242ENST00000488013 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-242ENST00000488013 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-242ENST00000488013 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-242ENST00000488013 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-242ENST00000488013 SPANXCQ9NY87 97 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-242ENST00000488013 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-242ENST00000488013 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-242ENST00000488013 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-242ENST00000488013 LITAFQ99732 161 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-242ENST00000488013 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-242ENST00000488013 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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