RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486829.1

ARHGEF3-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 428 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 NDUFA1O15239 70 aa7.46□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 KIAA0087Q14695 138 aa7.46□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.46□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 COX7B2Q8TF08 81 aa7.46□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.46□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.46□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.46□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 CKS1BP61024 79 aa7.45□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 SYCNQ0VAF6 134 aa7.45□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 CARD19Q96LW7 228 aa7.45□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP10-2P60368 255 aa7.44□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 RNF151Q2KHN1 245 aa7.44□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.44□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.43□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 SCGB1D1O95968 90 aa7.43□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.43□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.43□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 PKHD1P08F94 4074 aa7.43□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.42□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 E9PLD3 99 aa7.42□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 LEPROTO15243 131 aa7.42□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLPIP03973 132 aa7.42□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q6ZRU5 148 aa7.42□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 HERC2O95714 4834 aa7.42□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 C16orf90A8MZG2 172 aa7.41□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.41□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 GCSHP23434 173 aa7.41□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 NMUP48645 174 aa7.41□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 C2orf82Q6UX34 121 aa7.41□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 J3QQQ9 107 aa7.4□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.4□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 STPG4Q8N801 248 aa7.4□□□□□ -1.22
ARHGEF3-211ENST00000486829 HERV-K104P63124 156 aa7.39□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 ATOH7Q8N100 152 aa7.39□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.39□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.39□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.39□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.38□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.38□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.38□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 C10orf25Q5T742 122 aa7.38□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC00587B1AMM8 73 aa7.37□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.37□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 COX17Q14061 63 aa7.37□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.37□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.37□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 CDIP1Q9H305 208 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.36□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC01620Q4KN68 170 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 ERG28Q9UKR5 140 aa7.35□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP10-1P60331 282 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 PYY3Q5JQD4 70 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 VAMP8Q9BV40 100 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.34□□□□□ -1.23
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF815PA8K554 130 aa7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 CDK2AP2O75956 126 aa7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 PTTG1IPP53801 180 aa7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 MAJINQ3KP22 176 aa7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q6ZSA8 131 aa7.33□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 GAGE2BQ13066 116 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q6ZRP5 223 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 RYR1P21817 5038 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A096LNI7 61 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 PFN2P35080 140 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 GAGE2EQ4V326 116 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A0J9YXY3 114 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 TIMM17BO60830 172 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 SMIM6P0DI80 62 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC00158P58513 81 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 S100A12P80511 92 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPATA45Q537H7 98 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 PCP2Q8IVA1 136 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 SMIM13P0DJ93 91 aa7.29□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.29□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.29□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.28□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM238C9JI98 176 aa7.28□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 DLEU1O43261 78 aa7.28□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 CHTF8P0CG12 524 aa7.28□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 COX8AP10176 69 aa7.28□□□□□ -1.24
ARHGEF3-211ENST00000486829 DPH3Q96FX2 82 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 186.8 ms