RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 PMCHL1Q16048 86 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-209ENST00000484097 Q8IZM0 81 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A096LNJ9 63 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP4-209ENST00000484097 J3QL48 77 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP4-209ENST00000484097 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP5LO75964 103 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP4-209ENST00000484097 GAGE2EQ4V326 116 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP4-209ENST00000484097 GAGE2DQ9UEU5 116 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1W2PNN7 141 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 COLCA2A8K830 154 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 Q6ZRP5 223 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 H3BRM9 83 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 PDZD11Q5EBL8 140 aa12.07□□□□□ -0.48
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SH3BP4-209ENST00000484097 TRGC2P03986 189 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 CXCL5P42830 114 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 SMIM1B2RUZ4 78 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa12.05□□□□□ -0.48
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SH3BP4-209ENST00000484097 BAGE3Q86Y29 109 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 F8VRH5 84 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 SPINK8P0C7L1 97 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 COX7B2Q8TF08 81 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 OXTP01178 125 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 IGLC3P0DOY3 106 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 PRR3P79522 188 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
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SH3BP4-209ENST00000484097 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 IFI27L1Q96BM0 104 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM168BA1KXE4 195 aa11.99□□□□□ -0.49
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SH3BP4-209ENST00000484097 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM170BQ5T4T1 132 aa11.97□□□□□ -0.49
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SH3BP4-209ENST00000484097 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 MYCBP2O75592 4640 aa11.96□□□□□ -0.5
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SH3BP4-209ENST00000484097 M0QXV9 152 aa11.94□□□□□ -0.5
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SH3BP4-209ENST00000484097 HIST1H2BOP23527 126 aa11.89□□□□□ -0.51
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SH3BP4-209ENST00000484097 HIST1H2BNQ99877 126 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 HIST1H2BMQ99879 126 aa11.89□□□□□ -0.51
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SH3BP4-209ENST00000484097 PFN2P35080 140 aa11.87□□□□□ -0.51
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SH3BP4-209ENST00000484097 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 SFTA2Q6UW10 78 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 REG3GQ6UW15 175 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 HSPB8Q9UJY1 196 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM223A0PJW6 202 aa11.86□□□□□ -0.51
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SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa11.84□□□□□ -0.51
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SH3BP4-209ENST00000484097 NKAPP1Q8N9T2 125 aa11.8□□□□□ -0.52
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SH3BP4-209ENST00000484097 HERC1Q15751 4861 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 MT1HL1P0DM35 61 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 PLNP26678 52 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 LINC00158P58513 81 aa11.78□□□□□ -0.52
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SH3BP4-209ENST00000484097 DPM2O94777 84 aa11.76□□□□□ -0.53
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