RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCKP06307 115 aa11.94□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C3orf84H3BNL1 204 aa11.93□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LELP1Q5T871 98 aa11.93□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.93□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV1-51P01701 117 aa11.93□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa11.93□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.93□□□□□ -0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BRI3O95415 125 aa11.91□□□□□ -0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV4-1P06312 121 aa11.91□□□□□ -0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPDPFQ9H3Y8 114 aa11.89□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP17L23D6RBM5 183 aa11.88□□□□□ -0.51
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 B9D2Q9BPU9 175 aa11.88□□□□□ -0.51
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV10A0A0B4J240 114 aa11.87□□□□□ -0.51
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8IZM0 81 aa11.86□□□□□ -0.51
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FHL2Q14192 279 aa11.85□□□□□ -0.51
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.83□□□□□ -0.52
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CASC2Q6XLA1 102 aa11.81□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa11.8□□□□□ -0.52
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6Q795 121 aa11.7□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C16orf95Q9H693 158 aa11.7□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.7□□□□□ -0.54
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa11.68□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CELA1Q9UNI1 258 aa11.68□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa11.66□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6JHZ5 121 aa11.66□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8N9L7 120 aa11.66□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHD6Q8TD26 2715 aa11.66□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8N2B8 174 aa11.65□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1B0GUV1 79 aa11.65□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.64□□□□□ -0.55
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LY6G6CO95867 125 aa11.64□□□□□ -0.55
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LYPD5Q6UWN5 251 aa11.63□□□□□ -0.55
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa11.62□□□□□ -0.55
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MUC7Q8TAX7 377 aa11.62□□□□□ -0.55
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLAC8L1A1L4L8 177 aa11.61□□□□□ -0.55
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