RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.17□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.17□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 TNXBP22105 4242 aa8.17□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 A0A0J9YXV3 536 aa8.16□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 HIST1H2BKO60814 126 aa8.16□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 LEPROTL1O95214 131 aa8.16□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 HIST1H2BJP06899 126 aa8.16□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 PRSS2P07478 247 aa8.16□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 IGLC3P0DOY3 106 aa8.16□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 HIST1H2BOP23527 126 aa8.16□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 HIST1H2BBP33778 126 aa8.16□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 NDUFA6P56556 154 aa8.16□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 HIST1H2BDP58876 126 aa8.16□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 HIST1H2BCP62807 126 aa8.16□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.16□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.16□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.16□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.16□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.16□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 NDUFA1O15239 70 aa8.15□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 MT1HL1P0DM35 61 aa8.15□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 Q6ZRU5 148 aa8.15□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.15□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.15□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 CXCL5P42830 114 aa8.14□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 Q8IZM0 81 aa8.14□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 LINC00310P59036 64 aa8.13□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.13□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.12□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.12□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 GAGE2BQ13066 116 aa8.12□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 KIAA0087Q14695 138 aa8.12□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.12□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 C7orf33Q8WU49 177 aa8.12□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 A0A1W2PNN7 141 aa8.11□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.11□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 F8VRH5 84 aa8.11□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 CKS1BP61024 79 aa8.11□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.1□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 PTTG1IPP53801 180 aa8.1□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 ODF1Q14990 250 aa8.1□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.1□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 SFTA2Q6UW10 78 aa8.1□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.1□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.1□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.09□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 COX7B2Q8TF08 81 aa8.09□□□□□ -1.11
HPS1-211ENST00000478087 C11orf86A6NJI1 115 aa8.08□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 NUPR1O60356 82 aa8.08□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 FABP4P15090 132 aa8.08□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 PLNP26678 52 aa8.08□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.08□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 C10orf25Q5T742 122 aa8.08□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.07□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 SPINK8P0C7L1 97 aa8.07□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.07□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.06□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.05□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.04□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 H0Y8G0 127 aa8.04□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 DPM2O94777 84 aa8.04□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 AKR1D1P51857 326 aa8.04□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 HERVK_113P61574 105 aa8.04□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 C2orf82Q6UX34 121 aa8.04□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 TMEM223A0PJW6 202 aa8.03□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 FAM168BA1KXE4 195 aa8.03□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 PET117Q6UWS5 81 aa8.03□□□□□ -1.12
HPS1-211ENST00000478087 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.02□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 IGKCP01834 107 aa8.02□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 S100A6P06703 90 aa8.02□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 Q6ZRP5 223 aa8.02□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.02□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 LINC01600Q96MT4 127 aa8.02□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 C20orf202A1L168 122 aa8.01□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.01□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.01□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 LINC00587B1AMM8 73 aa8□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 COX17Q14061 63 aa8□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 GAGE2EQ4V326 116 aa8□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 LINC01545Q5VT33 79 aa8□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 SPINK6Q6UWN8 80 aa8□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 S100A2P29034 98 aa7.99□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP10-8P60410 259 aa7.99□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 HERV-K104P63124 156 aa7.99□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 LEPROTO15243 131 aa7.97□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 C3orf79P0CE67 100 aa7.97□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 NMUP48645 174 aa7.97□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
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