RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470095.5

HPS1-209, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-209ENST00000470095 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.33□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 C2orf48Q96LS8 159 aa9.32□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 KMT2AQ03164 3969 aa9.32□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 TSTD3H0UI37 97 aa9.31□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.31□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 C10orf25Q5T742 122 aa9.31□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.31□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.31□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.31□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 A0A0J9YXY3 114 aa9.3□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 RTL8CO15255 209 aa9.3□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 CKS1BP61024 79 aa9.3□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 HERV-K104P63124 156 aa9.3□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 SFTA2Q6UW10 78 aa9.3□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 A0A087WTM6 91 aa9.29□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 F8WDY8 70 aa9.29□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 SLPIP03973 132 aa9.29□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.29□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 C14orf177Q52M58 125 aa9.28□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 Q6ZRU5 148 aa9.28□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 LITAFQ99732 161 aa9.28□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.28□□□□□ -0.92
HPS1-209ENST00000470095 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 SYCNQ0VAF6 134 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 HIGD1BQ9P298 99 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 TIMM17BO60830 172 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 TNP2Q05952 138 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 Q8N814 137 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 CARD19Q96LW7 228 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 ERG28Q9UKR5 140 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 DNAH10Q8IVF4 4471 aa9.25□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.25□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.25□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 SMIM13P0DJ93 91 aa9.24□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 DDTP30046 118 aa9.24□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.24□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 A0A0U1RRA0 63 aa9.22□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 TMEM238C9JI98 176 aa9.22□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 PFN2P35080 140 aa9.22□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 RNF151Q2KHN1 245 aa9.22□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.22□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 SPANXCQ9NY87 97 aa9.22□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.22□□□□□ -0.93
HPS1-209ENST00000470095 LINC00587B1AMM8 73 aa9.21□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 LINC00158P58513 81 aa9.21□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 COX17Q14061 63 aa9.21□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 DAND5Q8N907 189 aa9.21□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 DNAH2Q9P225 4427 aa9.2□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.2□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9.2□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 PCP4L1A6NKN8 68 aa9.19□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 CTAG1AP78358 180 aa9.19□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 HSD52Q0P140 79 aa9.19□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.18□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 TAL2Q16559 108 aa9.18□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.18□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.17□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 EREGO14944 169 aa9.17□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.17□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.17□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 Q6ZVH6 145 aa9.17□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.17□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.17□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 HIST1H4GQ99525 98 aa9.17□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 PTTG1IPP53801 180 aa9.16□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 NPC2P61916 151 aa9.16□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 Q6ZRP5 223 aa9.16□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.16□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.16□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 RYR2Q92736 4967 aa9.15□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 IFITM1P13164 125 aa9.15□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.15□□□□□ -0.94
HPS1-209ENST00000470095 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa9.15□□□□□ -0.94
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HPS1-209ENST00000470095 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.14□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 KRTAP10-2P60368 255 aa9.14□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 LINC01620Q4KN68 170 aa9.14□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.14□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 CEND1Q8N111 149 aa9.14□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.14□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.14□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 BIRC6Q9NR09 4857 aa9.13□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 GCSHP23434 173 aa9.13□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 FXYD2P54710 66 aa9.13□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 GAGE2EQ4V326 116 aa9.13□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.13□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.13□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.13□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 A0A096LNI7 61 aa9.12□□□□□ -0.95
HPS1-209ENST00000470095 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.12□□□□□ -0.95
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