RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466964.1

LAMC1-202, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

TSL 4

Gene LAMC1, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-202ENST00000466964 SS18Q15532 418 aa5.91□□□□□ -1.46
LAMC1-202ENST00000466964 COX7A2LO14548 114 aa5.9□□□□□ -1.46
LAMC1-202ENST00000466964 CTRLP40313 264 aa5.9□□□□□ -1.46
LAMC1-202ENST00000466964 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.9□□□□□ -1.46
LAMC1-202ENST00000466964 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
LAMC1-202ENST00000466964 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.9□□□□□ -1.46
LAMC1-202ENST00000466964 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
LAMC1-202ENST00000466964 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.89□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 A0A1B0GUT8 65 aa5.89□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 A0A1B0GW15 77 aa5.89□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.89□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 LINC00587B1AMM8 73 aa5.89□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 F8WDY8 70 aa5.89□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 M0QXV9 152 aa5.89□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 SCGB1D1O95968 90 aa5.89□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 TSHBP01222 138 aa5.89□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 RIGQ13278 110 aa5.89□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 C10orf25Q5T742 122 aa5.89□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.89□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 BORCS7Q96B45 105 aa5.89□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 TSTD3H0UI37 97 aa5.88□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 PMCHP20382 165 aa5.88□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 MT1HP80294 61 aa5.88□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.88□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 TMEM101Q96IK0 257 aa5.88□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.88□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 MALP21145 153 aa5.87□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 SPAG11BQ08648 103 aa5.87□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.87□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 TPPP3Q9BW30 176 aa5.87□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 PRO1933Q9H354 126 aa5.87□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.87□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 I3L3M4 83 aa5.86□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 HSBP1O75506 76 aa5.86□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.86□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 KRTDAPP60985 99 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 UBE2BP63146 152 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 MRAP2Q96G30 205 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.84□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.84□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 DDTP30046 118 aa5.84□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 KIAA0087Q14695 138 aa5.84□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.84□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 C5orf38Q86SI9 138 aa5.84□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.84□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.84□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 FAM104AQ969W3 186 aa5.84□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
LAMC1-202ENST00000466964 NDUFA1O15239 70 aa5.83□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 CFC1BP0CG36 223 aa5.83□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.83□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.83□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.83□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.83□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 C3orf79P0CE67 100 aa5.82□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 RAB4AP20338 218 aa5.82□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 TWIST1Q15672 202 aa5.82□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 GAGE2EQ4V326 116 aa5.82□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.82□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.82□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 VAMP8Q9BV40 100 aa5.82□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.82□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.81□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 FA2HQ7L5A8 372 aa5.81□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.81□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 PRELID3AQ96N28 172 aa5.81□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 SSPOA2VEC9 5147 aa5.81□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.8□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 D6R8Y8 96 aa5.8□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 BCE1O60756 84 aa5.8□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 TNFRSF6BO95407 300 aa5.8□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 LINC00614P0C842 121 aa5.8□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 AMN1Q8IY45 258 aa5.8□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 ORMDL3Q8N138 153 aa5.8□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.8□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 TMEM191AQ9H0A3 160 aa5.8□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.79□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 LEPROTL1O95214 131 aa5.79□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 CKS2P33552 79 aa5.79□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 PMCHL1Q16048 86 aa5.79□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 Q6ZUT4 128 aa5.79□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.79□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 SVIPQ8NHG7 77 aa5.79□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 C14orf144Q96I85 54 aa5.79□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.79□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 C22orf24Q9Y442 160 aa5.79□□□□□ -1.48
LAMC1-202ENST00000466964 C20orf202A1L168 122 aa5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms