RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 LITAFQ99732 161 aa6.28□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A0B4J2C4 111 aa6.27□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 ENHOQ6UWT2 76 aa6.27□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 NUPR2A6NF83 97 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 KLK12Q9UKR0 248 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 APLNQ9ULZ1 77 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.26□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 K7ERJ3 54 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 COX7A2LO14548 114 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 A4D1N5 150 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 J3QR89 54 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 CRPP02741 224 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 CFC1BP0CG36 223 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 CFC1P0CG37 223 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 FOXI1Q12951 378 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q8IZM0 81 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q9H8V8 135 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.24□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 APOMO95445 188 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 XCL1P47992 114 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q8N3U1 123 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 COX7B2Q8TF08 81 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 COL7A1Q02388 2944 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.23□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3-33P01772 117 aa6.22□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 CXCL5P42830 114 aa6.22□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.22□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.22□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 C5orf38Q86SI9 138 aa6.22□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.22□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 F8WDY8 70 aa6.22□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 TSPAN13O95857 204 aa6.22□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRSS2P07478 247 aa6.22□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.22□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 UBE2WQ96B02 151 aa6.22□□□□□ -1.41
CCNDBP1-202ENST00000444658 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.21□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 F8W1H4 67 aa6.21□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 MALP21145 153 aa6.21□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 KIAA0087Q14695 138 aa6.21□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 COX17Q14061 63 aa6.2□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.2□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 SVIPQ8NHG7 77 aa6.2□□□□□ -1.42
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CCNDBP1-202ENST00000444658 ERG28Q9UKR5 140 aa6.2□□□□□ -1.42
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CCNDBP1-202ENST00000444658 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.19□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.19□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.19□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1B0GV72 72 aa6.19□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.19□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 CFAP161Q6P656 301 aa6.19□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 MTURNQ8N3F0 131 aa6.19□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.19□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.19□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 SIGMAR1Q99720 223 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 CKS1BP61024 79 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 C2orf48Q96LS8 159 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 COX6CP09669 75 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 XP32Q5T750 250 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.15□□□□□ -1.43
CCNDBP1-202ENST00000444658 H3BMG7 143 aa6.15□□□□□ -1.43
CCNDBP1-202ENST00000444658 M0QXV9 152 aa6.15□□□□□ -1.43
CCNDBP1-202ENST00000444658 TTC32Q5I0X7 151 aa6.15□□□□□ -1.43
CCNDBP1-202ENST00000444658 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.15□□□□□ -1.43
CCNDBP1-202ENST00000444658 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.15□□□□□ -1.43
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.14□□□□□ -1.43
CCNDBP1-202ENST00000444658 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.14□□□□□ -1.43
CCNDBP1-202ENST00000444658 PSMB2P49721 201 aa6.14□□□□□ -1.43
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPAG11BQ08648 103 aa6.14□□□□□ -1.43
CCNDBP1-202ENST00000444658 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.14□□□□□ -1.43
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC01600Q96MT4 127 aa6.14□□□□□ -1.43
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRO0461Q9UI25 63 aa6.14□□□□□ -1.43
CCNDBP1-202ENST00000444658 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-202ENST00000444658 TCL1BO95988 128 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00158P58513 81 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q1RN00 199 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-202ENST00000444658 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.13□□□□□ -1.43
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