RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 DEFB1P60022 68 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-209ENST00000442510 DEFB123Q8N688 67 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-209ENST00000442510 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-209ENST00000442510 OCR1Q9BZK8 76 aa3.89□□□□□ -1.79
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PTPRC-209ENST00000442510 ADAMTS20P59510 1910 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-209ENST00000442510 G3V318 75 aa3.89□□□□□ -1.79
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PTPRC-209ENST00000442510 A6NDX4 124 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRC-209ENST00000442510 DEFB130AP0DP74 79 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRC-209ENST00000442510 PLXNB2O15031 1838 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-209ENST00000442510 THSD7BQ9C0I4 1608 aa3.81□□□□□ -1.8
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PTPRC-209ENST00000442510 H3BUA1 57 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-209ENST00000442510 BRD3OSQ6XYD6 125 aa3.8□□□□□ -1.8
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PTPRC-209ENST00000442510 A8MWP4 228 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-209ENST00000442510 PCNX1Q96RV3 2341 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-209ENST00000442510 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-209ENST00000442510 LY6G6DO95868 133 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-209ENST00000442510 TLX1NBP0CAT3 122 aa3.78□□□□□ -1.8
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PTPRC-209ENST00000442510 IGLV1-44P01699 117 aa3.77□□□□□ -1.81
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