RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STPG4Q8N801 248 aa5.43□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.43□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CKS1BP61024 79 aa5.42□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIAA0087Q14695 138 aa5.42□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PDZD11Q5EBL8 140 aa5.42□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.42□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CST9LQ9H4G1 147 aa5.42□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.41□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SFTA2Q6UW10 78 aa5.41□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.41□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.41□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A096LNJ9 63 aa5.4□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A0J9YXV3 536 aa5.4□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.4□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 F8VRH5 84 aa5.4□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OXTP01178 125 aa5.4□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGLC3P0DOY3 106 aa5.4□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GAGE2BQ13066 116 aa5.4□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.4□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.4□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.4□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.39□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.39□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.39□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.39□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.39□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSBP1O75506 76 aa5.38□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 Q6ZRP5 223 aa5.38□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BAGE3Q86Y29 109 aa5.38□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa5.38□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COX7B2Q8TF08 81 aa5.38□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.37□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.37□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C10orf25Q5T742 122 aa5.37□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRGC2P03986 189 aa5.36□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NDUFA6P56556 154 aa5.36□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C2orf82Q6UX34 121 aa5.36□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.36□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A1W2PNN7 141 aa5.35□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COLCA2A8K830 154 aa5.35□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PMCHL1Q16048 86 aa5.35□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.35□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LEPROTL1O95214 131 aa5.34□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPINK8P0C7L1 97 aa5.34□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COX17Q14061 63 aa5.34□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GAGE2EQ4V326 116 aa5.34□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.34□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.34□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.34□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.34□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.34□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HERC1Q15751 4861 aa5.34□□□□□ -1.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C11orf86A6NJI1 115 aa5.33□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 M0QXV9 152 aa5.33□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.33□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.33□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC00587B1AMM8 73 aa5.32□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SERF1AO75920 110 aa5.32□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLNP26678 52 aa5.32□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 REG3GQ6UW15 175 aa5.32□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBE2BP63146 152 aa5.31□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.31□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.3□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.3□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM223A0PJW6 202 aa5.3□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUPR1O60356 82 aa5.3□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HERV-K104P63124 156 aa5.3□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.3□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERG28Q9UKR5 140 aa5.3□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM168BA1KXE4 195 aa5.29□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC00310P59036 64 aa5.29□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HERVK_113P61574 105 aa5.29□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.29□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C1orf137Q5JT78 98 aa5.29□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DIRC1Q969H9 104 aa5.29□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.29□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HIST1H2BKO60814 126 aa5.28□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DPM2O94777 84 aa5.28□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGLV7-43P04211 117 aa5.28□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HIST1H2BJP06899 126 aa5.28□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 S100A1P23297 94 aa5.28□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HIST1H2BOP23527 126 aa5.28□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HIST1H2BBP33778 126 aa5.28□□□□□ -1.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HIST1H2BDP58876 126 aa5.28□□□□□ -1.56
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