RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 A0A087WYN8 130 aa4.87□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.87□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.87□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 RNF151Q2KHN1 245 aa4.87□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.87□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 LCE3BQ5TA77 95 aa4.87□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 C5orf38Q86SI9 138 aa4.87□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 DPH3Q96FX2 82 aa4.87□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.87□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS2P07478 247 aa4.86□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFA6P56556 154 aa4.86□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 SPAG11BQ08648 103 aa4.86□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 SYCNQ0VAF6 134 aa4.86□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 MAJINQ3KP22 176 aa4.86□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.86□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00469Q8N7U9 141 aa4.86□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 ORAOV1Q8WV07 137 aa4.86□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.86□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 CARD19Q96LW7 228 aa4.86□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.86□□□□□ -1.63
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SGMS1-201ENST00000361543 A0A096LNI7 61 aa4.85□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 A0A096LNJ9 63 aa4.85□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.85□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 C9orf118A6NHY6 69 aa4.85□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 B5MCH6 92 aa4.85□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFA1O15239 70 aa4.85□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 SERF1AO75920 110 aa4.85□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 LEPROTL1O95214 131 aa4.85□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 CXCL5P42830 114 aa4.85□□□□□ -1.63
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SGMS1-201ENST00000361543 SFTA2Q6UW10 78 aa4.85□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.85□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.85□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H2BKO60814 126 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 OXTP01178 125 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H2BJP06899 126 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 IGLC3P0DOY3 106 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H2BOP23527 126 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H2BBP33778 126 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H2BDP58876 126 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00310P59036 64 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 CKS1BP61024 79 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H2BCP62807 126 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 PMCHL1Q16048 86 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 Q8IZM0 81 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 STPG4Q8N801 248 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 C7orf33Q8WU49 177 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.84□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.84□□□□□ -1.63
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SGMS1-201ENST00000361543 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.83□□□□□ -1.64
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SGMS1-201ENST00000361543 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.82□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZRU5 148 aa4.82□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.82□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 PTTG1IPP53801 180 aa4.81□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.81□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.8□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.8□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.8□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 HERVK_113P61574 105 aa4.8□□□□□ -1.64
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SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.8□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.79□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 C20orf202A1L168 122 aa4.79□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.79□□□□□ -1.64
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SGMS1-201ENST00000361543 S100A6P06703 90 aa4.79□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 FABP4P15090 132 aa4.79□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA0087Q14695 138 aa4.79□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 C11orf86A6NJI1 115 aa4.78□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00587B1AMM8 73 aa4.78□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 H0Y8G0 127 aa4.78□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 SPINK8P0C7L1 97 aa4.78□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 PET117Q6UWS5 81 aa4.78□□□□□ -1.64
SGMS1-201ENST00000361543 IGKCP01834 107 aa4.77□□□□□ -1.65
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