RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 FSHBP01225 129 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRD-201ENST00000355233 A0A096LNJ9 63 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0J9YWU9 116 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRD-201ENST00000355233 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRD-201ENST00000355233 A8MTW9 85 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRD-201ENST00000355233 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRD-201ENST00000355233 Q6ZRP5 223 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRD-201ENST00000355233 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
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PTPRD-201ENST00000355233 ODF3L2Q3SX64 289 aa3.4□□□□□ -1.86
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PTPRD-201ENST00000355233 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 COX6A2Q02221 97 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
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