RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299084.8

SPRED1-201, Transcript of sprouty related EVH1 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRED1, Length 7,780 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED1-201ENST00000299084 C16orf90A8MZG2 172 aa10.45□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 F8WDY8 70 aa10.45□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 PTPRBP23467 1997 aa10.45□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 CHCHD7Q9BUK0 85 aa10.45□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 MYO9AB2RTY4 2548 aa10.45□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 Q6ZTC4 211 aa10.44□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 NRACQ8N912 160 aa10.44□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 ADAMTS20P59510 1910 aa10.43□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa10.43□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 C2CD3Q4AC94 2353 aa10.43□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 TP73-AS1Q9UF72 201 aa10.43□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 Q9UF83 564 aa10.43□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa10.42□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa10.42□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa10.41□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 FHL2Q14192 279 aa10.41□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa10.4□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 TSHBP01222 138 aa10.4□□□□□ -0.74
SPRED1-201ENST00000299084 TYMSOSQ8TAI1 123 aa10.4□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 A0A087WSZ3 146 aa10.4□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 A0A087WVE0 104 aa10.38□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa10.38□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 Q8N814 137 aa10.38□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa10.37□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 CUL9Q8IWT3 2517 aa10.37□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa10.37□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 FSTL3O95633 263 aa10.37□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 Q8N3U1 123 aa10.37□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 TMEM254Q8TBM7 123 aa10.37□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 MDFIQ99750 246 aa10.36□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 PRM2P04554 102 aa10.36□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 Q8N2B8 174 aa10.36□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 C11orf71Q6IPW1 123 aa10.35□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 MOBPQ13875 183 aa10.35□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa10.34□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 C1orf64Q8NEQ6 169 aa10.34□□□□□ -0.75
SPRED1-201ENST00000299084 YPEL4Q96NS1 127 aa10.33□□□□□ -0.76
SPRED1-201ENST00000299084 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa10.33□□□□□ -0.76
SPRED1-201ENST00000299084 LINC00313P59037 77 aa10.32□□□□□ -0.76
SPRED1-201ENST00000299084 PRR3P79522 188 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SPRED1-201ENST00000299084 Q6ZS46 218 aa10.31□□□□□ -0.76
SPRED1-201ENST00000299084 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
SPRED1-201ENST00000299084 COL4A3Q01955 1670 aa10.29□□□□□ -0.76
SPRED1-201ENST00000299084 C8orf87E5RJ46 101 aa10.29□□□□□ -0.76
SPRED1-201ENST00000299084 A0A087WYN8 130 aa10.29□□□□□ -0.76
SPRED1-201ENST00000299084 FHL3Q13643 280 aa10.29□□□□□ -0.76
SPRED1-201ENST00000299084 F8P00451 2351 aa10.29□□□□□ -0.76
SPRED1-201ENST00000299084 CXCL6P80162 114 aa10.28□□□□□ -0.76
SPRED1-201ENST00000299084 SMCR5Q8TEV8 140 aa10.28□□□□□ -0.76
SPRED1-201ENST00000299084 Q8N6K4 173 aa10.28□□□□□ -0.76
SPRED1-201ENST00000299084 LINC00574Q9H8X3 128 aa10.28□□□□□ -0.76
SPRED1-201ENST00000299084 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa10.28□□□□□ -0.76
SPRED1-201ENST00000299084 C6orf48Q9UBA6 75 aa10.27□□□□□ -0.77
SPRED1-201ENST00000299084 KLLNB2CW77 178 aa10.27□□□□□ -0.77
SPRED1-201ENST00000299084 LYPD5Q6UWN5 251 aa10.27□□□□□ -0.77
SPRED1-201ENST00000299084 IGLV1-51P01701 117 aa10.26□□□□□ -0.77
SPRED1-201ENST00000299084 IGLV1-40P01703 118 aa10.26□□□□□ -0.77
SPRED1-201ENST00000299084 C16orf95Q9H693 158 aa10.25□□□□□ -0.77
SPRED1-201ENST00000299084 Q96NJ1 140 aa10.25□□□□□ -0.77
SPRED1-201ENST00000299084 CRIP1P50238 77 aa10.24□□□□□ -0.77
SPRED1-201ENST00000299084 KIAA0087Q14695 138 aa10.24□□□□□ -0.77
SPRED1-201ENST00000299084 C22orf24Q9Y442 160 aa10.24□□□□□ -0.77
SPRED1-201ENST00000299084 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SPRED1-201ENST00000299084 Q6ZRP5 223 aa10.23□□□□□ -0.77
SPRED1-201ENST00000299084 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
SPRED1-201ENST00000299084 WISP2O76076 250 aa10.21□□□□□ -0.77
SPRED1-201ENST00000299084 ACANP16112 2415 aa10.21□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 CDIP1Q9H305 208 aa10.2□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa10.2□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 RTL8CO15255 209 aa10.19□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 C2orf91Q6ZV80 131 aa10.19□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 PRO0628Q9UI54 55 aa10.19□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 CHTF8P0CG12 524 aa10.18□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 BRWD1-AS2P59051 145 aa10.18□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 SMIM29Q86T20 159 aa10.18□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 Q6ZRU5 148 aa10.18□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 APLNQ9ULZ1 77 aa10.18□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 ODF3L2Q3SX64 289 aa10.17□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 LINC00242Q5T6M2 205 aa10.17□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 CRIPTQ9P021 101 aa10.17□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 PRR9Q5T870 116 aa10.17□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 A8MTW9 85 aa10.16□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 A0A1B0GUV1 79 aa10.16□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa10.15□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 TRAV22A0A0B4J277 110 aa10.15□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 SMIM1B2RUZ4 78 aa10.15□□□□□ -0.78
SPRED1-201ENST00000299084 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa10.14□□□□□ -0.79
SPRED1-201ENST00000299084 FN1P02751 2386 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
SPRED1-201ENST00000299084 Q8NBF4 154 aa10.13□□□□□ -0.79
SPRED1-201ENST00000299084 LINC01561Q8N1V8 128 aa10.12□□□□□ -0.79
SPRED1-201ENST00000299084 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa10.12□□□□□ -0.79
SPRED1-201ENST00000299084 KRTAP10-9P60411 292 aa10.11□□□□□ -0.79
SPRED1-201ENST00000299084 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
SPRED1-201ENST00000299084 C4orf26Q17RF5 130 aa10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms