RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.52□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM223A0PJW6 202 aa8.51□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.51□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 COX7B2Q8TF08 81 aa8.51□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.51□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 RYR1P21817 5038 aa8.51□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.5□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 IGKCP01834 107 aa8.5□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 KRTDAPP60985 99 aa8.5□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 C10orf25Q5T742 122 aa8.5□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 C2orf82Q6UX34 121 aa8.5□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.5□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.5□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.5□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.5□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 CKS1BP61024 79 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 CDK2AP2O75956 126 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 C20orf202A1L168 122 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC42-201ENST00000293845 HERVK_113P61574 105 aa8.46□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 SFTA2Q6UW10 78 aa8.46□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 A0A096LNI7 61 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 AKR1D1P51857 326 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 XGP55808 180 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 PANO1I0J062 215 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 PTTG1IPP53801 180 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 E9PLD3 99 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 LEPROTO15243 131 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 CHTF8P0CG12 524 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 HSPG2P98160 4391 aa8.42□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.42□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 Q6ZRP5 223 aa8.42□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 SCXQ7RTU7 201 aa8.42□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 J3QQQ9 107 aa8.41□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.41□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 GAGE2BQ13066 116 aa8.41□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.41□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 MAJINQ3KP22 176 aa8.4□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 STPG4Q8N801 248 aa8.4□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.4□□□□□ -1.06
CCDC42-201ENST00000293845 HERC2O95714 4834 aa8.39□□□□□ -1.07
CCDC42-201ENST00000293845 A0A087WYN8 130 aa8.39□□□□□ -1.07
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CCDC42-201ENST00000293845 HERV-K104P63124 156 aa8.39□□□□□ -1.07
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CCDC42-201ENST00000293845 ERG28Q9UKR5 140 aa8.39□□□□□ -1.07
CCDC42-201ENST00000293845 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC42-201ENST00000293845 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
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CCDC42-201ENST00000293845 ATOH7Q8N100 152 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC42-201ENST00000293845 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.38□□□□□ -1.07
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CCDC42-201ENST00000293845 DPH3Q96FX2 82 aa8.36□□□□□ -1.07
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CCDC42-201ENST00000293845 PFN2P35080 140 aa8.35□□□□□ -1.07
CCDC42-201ENST00000293845 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.35□□□□□ -1.07
CCDC42-201ENST00000293845 SCGB1D1O95968 90 aa8.35□□□□□ -1.07
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1W2PNN7 141 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC42-201ENST00000293845 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CCDC42-201ENST00000293845 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC42-201ENST00000293845 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC42-201ENST00000293845 FAT1Q14517 4588 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 A0A0J9YXY3 114 aa8.32□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 FAM168BA1KXE4 195 aa8.32□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.32□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 SMIM13P0DJ93 91 aa8.32□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00158P58513 81 aa8.32□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.32□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 Q8N1X5 172 aa8.32□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.32□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF815PA8K554 130 aa8.31□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.31□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.31□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 A0A0U1RRA0 63 aa8.3□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.3□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.3□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.3□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.29□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 TIMM17BO60830 172 aa8.28□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 PYY3Q5JQD4 70 aa8.28□□□□□ -1.08
CCDC42-201ENST00000293845 PCP2Q8IVA1 136 aa8.28□□□□□ -1.08
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