RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 CADP27708 2225 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 M0R2N4 97 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 HCFC1P51610 2035 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 H0Y9P7 68 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 PRM2P04554 102 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 EML5Q05BV3 1969 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 Q8N3U1 123 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 X6R8D5 127 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 POLEQ07864 2286 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00208Q96KT6 92 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 SPTBN2O15020 2390 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 Q8NBF4 154 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 SVIPQ8NHG7 77 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 ROS1P08922 2347 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 CRYGAP11844 174 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 ERC2-IT1O76042 136 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 C16orf90A8MZG2 172 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 SMR3AQ99954 134 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 C8orf87E5RJ46 101 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 A0A087WSZ3 146 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00846Q9NV44 126 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZRX8 168 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 C1orf195Q5TG92 126 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
PTPRB-201ENST00000261266 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 CDIP1Q9H305 208 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZQT0 140 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 Q8NAQ8 132 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 CACNA1GO43497 2377 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 KIAA0087Q14695 138 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00167Q96N53 147 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 MDFIQ99750 246 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 MOBPQ13875 183 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 PRO0461Q9UI25 63 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 ACYP2P14621 99 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZRP5 223 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 PCSK5Q92824 1860 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 IGLV6-57P01721 117 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 PTPRBP23467 1997 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 A0A087WVE0 104 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-201ENST00000261266 LITAFQ99732 161 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 ACACBO00763 2458 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 PLCE1Q9P212 2302 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 RTL8CO15255 209 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 PRLHP81277 87 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 CREBBPQ92793 2442 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 SMIM29Q86T20 159 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 VPREB1P12018 145 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 PRR34Q9NV39 138 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 A0A096LNT2 108 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 TTC28Q96AY4 2481 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 FAM229AH3BQW9 127 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 A8MWP4 228 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.1□□□□□ -1.43
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