RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637383.1

SMARCA2-262, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5

Gene SMARCA2, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-262	ENST00000637383	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	APOM	O95445	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	RAB5A	P20339	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383		A0A1W2PNN7	141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	RAB14	P61106	215 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	XP32	Q5T750	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383		A0A0J9YXV3	536 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383		F8WDY8	70 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383		Q6ZRP5	223 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383		Q8N8P6	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383		A0A087WZ39	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	NDUFA1	O15239	70 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383		K7EMI3	77 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	UBE2D1	P51668	147 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383		Q6ZN92	141 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	AMELX	Q99217	191 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	VCX2	Q9H322	139 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	MT-ND6	P03923	174 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	NPS	P0C0P6	89 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SMARCA2-262	ENST00000637383	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	IFITM2	Q01629	132 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	ODF1	Q14990	250 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	G0S2	P27469	103 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-262	ENST00000637383	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112 ms