RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622079.1

LINC00869-209, long intergenic non-protein coding RNA 869, human

TSL 1 (best)

Gene LINC00869, Length 1,064 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00869-209	ENST00000622079	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	C17orf51	A8MQB3	221 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079		J3QRE1	110 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	IGKV1-16	P04430	117 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	IFI6	P09912	130 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	ZNF32	P17041	273 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	RPRML	Q8N4K4	120 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	TMEM141	Q96I45	108 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	GTF3C1	Q12789	2109 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	SH2D1A	O60880	128 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	ERC2-IT1	O76042	136 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	IGKV1-39	P01597	117 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	IGKV1D-39	P04432	117 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	C2orf82	Q6UX34	121 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	ORMDL3	Q8N138	153 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	NABP2	Q9BQ15	211 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00869-209	ENST00000622079	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079		A0A1B0GVX0	72 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	LINC01549	A6NIU2	74 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	BPY2	O14599	106 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	LEPROT	O15243	131 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	KISS1	Q15726	138 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
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LINC00869-209	ENST00000622079	C20orf197	Q8N268	126 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	LINC01006	Q8NI28	216 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	ATR	Q13535	2644 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	COL6A5	A8TX70	2615 aa		3.26	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		3.26	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		3.26	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	C11orf94	C9JXX5	98 aa		3.26	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	GNRH2	O43555	120 aa		3.26	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	COX6C	P09669	75 aa		3.26	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	FXYD7	P58549	80 aa		3.26	□□□□□ -1.89
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LINC00869-209	ENST00000622079	C15orf56	Q8N910	161 aa		3.26	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079		V9GYV3	84 aa		3.26	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		3.25	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		3.25	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		3.25	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		3.25	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	MIF	P14174	115 aa		3.25	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	NPPC	P23582	126 aa		3.25	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	DYNLT1	P63172	113 aa		3.25	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	SYCN	Q0VAF6	134 aa		3.25	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.25	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.25	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		3.25	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		3.25	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		3.25	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		3.24	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	TMEM223	A0PJW6	202 aa		3.24	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	3.24	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	IGKV1D-12	P01611	117 aa		3.24	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	S100A3	P33764	101 aa		3.24	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	FXYD6P3	P58550	94 aa		3.24	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	3.24	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		3.24	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	DEFB106A	Q8N104	65 aa		3.24	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	LIMD2	Q9BT23	127 aa		3.24	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		3.24	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	CUBN	O60494	3623 aa		3.24	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	SDK2	Q58EX2	2172 aa		3.24	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	MED13	Q9UHV7	2174 aa		3.24	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		3.23	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		3.23	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		3.23	□□□□□ -1.89
LINC00869-209	ENST00000622079	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		3.23	□□□□□ -1.89

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