RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 BORCS7Q96B45 105 aa15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM191AQ9H0A3 160 aa15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf196B1AJZ1 125 aa15.67■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 MT-ND6P03923 174 aa15.67■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB4AP20338 218 aa15.67■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 HIGD1CA8MV81 97 aa15.66■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 COX19Q49B96 90 aa15.66■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 AMN1Q8IY45 258 aa15.66■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GUT8 65 aa15.64■□□□□ 0.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SMKR1H3BMG3 65 aa15.64■□□□□ 0.09
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf137Q5JT78 98 aa15.64■□□□□ 0.09
CAPNS1-211ENST00000590874 C2orf48Q96LS8 159 aa15.64■□□□□ 0.09
CAPNS1-211ENST00000590874 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa15.63■□□□□ 0.09
CAPNS1-211ENST00000590874 C5orf38Q86SI9 138 aa15.63■□□□□ 0.09
CAPNS1-211ENST00000590874 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CAPNS1-211ENST00000590874 FCER1GP30273 86 aa15.62■□□□□ 0.09
CAPNS1-211ENST00000590874 VCYO14598 125 aa15.61■□□□□ 0.09
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZUT4 128 aa15.61■□□□□ 0.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SPAG11BQ08648 103 aa15.6■□□□□ 0.09
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR26Q8N8Z3 221 aa15.6■□□□□ 0.09
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GW15 77 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-211ENST00000590874 S100A8P05109 93 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-211ENST00000590874 NRACQ8N912 160 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GXF2 115 aa15.58■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 RIGQ13278 110 aa15.58■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 HBBP68871 147 aa15.57■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 GNB1LQ9BYB4 327 aa15.57■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV7-43P04211 117 aa15.56■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 SMAGPQ0VAQ4 97 aa15.56■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF151Q2KHN1 245 aa15.56■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa15.56■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 DIRC1Q969H9 104 aa15.55■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR2DL4Q99706 377 aa15.55■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM168BA1KXE4 195 aa15.53■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10D4PQ8NGN7 298 aa15.53■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TIMM21Q9BVV7 248 aa15.53■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R17O96001 155 aa15.52■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB5BP61020 215 aa15.52■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM136Q6ZRR5 245 aa15.52■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa15.52■□□□□ 0.08
CAPNS1-211ENST00000590874 H0Y9J4 135 aa15.51■□□□□ 0.07
CAPNS1-211ENST00000590874 TRGC2P03986 189 aa15.51■□□□□ 0.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ORAOV1Q8WV07 137 aa15.51■□□□□ 0.07
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087WZ39 114 aa15.5■□□□□ 0.07
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf25Q5T742 122 aa15.5■□□□□ 0.07
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM104AQ969W3 186 aa15.5■□□□□ 0.07
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM18Q96B42 140 aa15.49■□□□□ 0.07
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL39P62891 51 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CAPNS1-211ENST00000590874 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa15.47■□□□□ 0.07
CAPNS1-211ENST00000590874 FABP9Q0Z7S8 132 aa15.47■□□□□ 0.07
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFA1O15239 70 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-211ENST00000590874 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-211ENST00000590874 C6orf48Q9UBA6 75 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-211ENST00000590874 F8WDY8 70 aa15.45■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 TLX1NBP0CAT3 122 aa15.45■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM104BQ5XKR9 115 aa15.45■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa15.45■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 C20orf78Q9BR46 151 aa15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 GAGE2EQ4V326 116 aa15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 GAGE2DQ9UEU5 116 aa15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H2BKO60814 126 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H2BJP06899 126 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H2BOP23527 126 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H2BBP33778 126 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H2BDP58876 126 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H2BCP62807 126 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL32P62910 135 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST2H2BEQ16778 126 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H2BHQ93079 126 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H2BNQ99877 126 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H2BMQ99879 126 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 SPANXA1Q9NS26 97 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-211ENST00000590874 IFITM10A6NMD0 228 aa15.39■□□□□ 0.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFRSF6BO95407 300 aa15.39■□□□□ 0.05
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM2Q9BVW6 85 aa15.39■□□□□ 0.05
CAPNS1-211ENST00000590874 MUC2Q02817 5179 aa15.39■□□□□ 0.05
CAPNS1-211ENST00000590874 M0QXV9 152 aa15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TCAPO15273 167 aa15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1-211ENST00000590874 CKS2P33552 79 aa15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA0087Q14695 138 aa15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1-211ENST00000590874 S100A6P06703 90 aa15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2D1P51668 147 aa15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2BP63146 152 aa15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR4Q16378 134 aa15.36■□□□□ 0.05
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