RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590104.1

LAMA3-211, Transcript of laminin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 5

Gene LAMA3, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3-211ENST00000590104 NRACQ8N912 160 aa4.11□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 C20orf78Q9BR46 151 aa4.11□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.11□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.11□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.11□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa4.1□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 F8W036 122 aa4.1□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 TSHBP01222 138 aa4.1□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 PPBPP02775 128 aa4.1□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 PEA15Q15121 130 aa4.1□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 MAJINQ3KP22 176 aa4.1□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 REG3GQ6UW15 175 aa4.1□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.1□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 ALKAL2Q6UX46 152 aa4.1□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 C2orf48Q96LS8 159 aa4.1□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.09□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.09□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.09□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 COX7A2LO14548 114 aa4.09□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 PHOX2AO14813 284 aa4.09□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 NPSP0C0P6 89 aa4.09□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 XCL1P47992 114 aa4.09□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 CEBPGP53567 150 aa4.09□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 SYCNQ0VAF6 134 aa4.09□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 Q6ZRP5 223 aa4.09□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 STPG4Q8N801 248 aa4.09□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 CARD19Q96LW7 228 aa4.09□□□□□ -1.75
LAMA3-211ENST00000590104 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.08□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 PANO1I0J062 215 aa4.08□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 SRP19P09132 144 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 CAMPP49913 170 aa4.08□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.08□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.08□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 NUP35Q8NFH5 326 aa4.08□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 LINC01600Q96MT4 127 aa4.08□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.08□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 TMEM242Q9NWH2 141 aa4.08□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 NAT8Q9UHE5 227 aa4.08□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 V9GYV3 84 aa4.08□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 G0S2P27469 103 aa4.07□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 CKS2P33552 79 aa4.07□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 AMN1Q8IY45 258 aa4.07□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 OR10D4PQ8NGN7 298 aa4.07□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 IMMP2LQ96T52 175 aa4.07□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.07□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.06□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 CHTF8P0CG12 524 aa4.06□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 RAB5AP20339 215 aa4.06□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.06□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.06□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.06□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.05□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 A0A096LNI7 61 aa4.05□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa4.05□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 PRSS47A8MTI9 375 aa4.05□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 K7EMI3 77 aa4.05□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 TNFRSF6BO95407 300 aa4.05□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 HBBP68871 147 aa4.05□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.05□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 ADIRFQ15847 76 aa4.05□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.05□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 A0A0J9YXV3 536 aa4.04□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 NDUFA1O15239 70 aa4.04□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.04□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 ORMDL3Q8N138 153 aa4.04□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.04□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.04□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.03□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.03□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 LINC01549A6NIU2 74 aa4.03□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.03□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 SEC11AP67812 179 aa4.03□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 GAGE2BQ13066 116 aa4.03□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.03□□□□□ -1.76
LAMA3-211ENST00000590104 A0A087WZ39 114 aa4.02□□□□□ -1.77
LAMA3-211ENST00000590104 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.02□□□□□ -1.77
LAMA3-211ENST00000590104 SMKR1H3BMG3 65 aa4.02□□□□□ -1.77
LAMA3-211ENST00000590104 MT-ND4LP03901 98 aa4.02□□□□□ -1.77
LAMA3-211ENST00000590104 MT-ND6P03923 174 aa4.02□□□□□ -1.77
LAMA3-211ENST00000590104 KRTAP10-8P60410 259 aa4.02□□□□□ -1.77
LAMA3-211ENST00000590104 RAB14P61106 215 aa4.02□□□□□ -1.77
LAMA3-211ENST00000590104 SPAG11BQ08648 103 aa4.02□□□□□ -1.77
LAMA3-211ENST00000590104 C10orf25Q5T742 122 aa4.02□□□□□ -1.77
LAMA3-211ENST00000590104 C5orf38Q86SI9 138 aa4.02□□□□□ -1.77
LAMA3-211ENST00000590104 DIRC1Q969H9 104 aa4.02□□□□□ -1.77
LAMA3-211ENST00000590104 A0A1B0GXF2 115 aa4.01□□□□□ -1.77
LAMA3-211ENST00000590104 IFITM10A6NMD0 228 aa4.01□□□□□ -1.77
LAMA3-211ENST00000590104 D6R8Y8 96 aa4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms