RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589853.3

GTF3C2-AS1-207, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RBX1P62877 108 aa3.34□□□□□ -1.87
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IQCJQ1A5X6 159 aa3.34□□□□□ -1.87
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SPANXN1Q5VSR9 72 aa3.34□□□□□ -1.87
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ISOC2Q96AB3 205 aa3.34□□□□□ -1.87
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PGLYRP4Q96LB8 373 aa3.34□□□□□ -1.87
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CHCHD7Q9BUK0 85 aa3.34□□□□□ -1.87
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SNAPINO95295 136 aa3.33□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MGPP08493 103 aa3.33□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CEBPGP53567 150 aa3.33□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RPS20P60866 119 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NDUFA5Q16718 116 aa3.33□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.33□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NUP35Q8NFH5 326 aa3.33□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UBE2WQ96B02 151 aa3.33□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SMDT1Q9H4I9 107 aa3.33□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 K7EP13 123 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NCR2O95944 276 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ESDP10768 282 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ADCYAP1P18509 176 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RAB4AP20338 218 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CACNG7P62955 275 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PEA15Q15121 130 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 Q5VSD8 79 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KCNIP4Q6PIL6 250 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RASL11AQ6T310 242 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 AMN1Q8IY45 258 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C10orf126Q8N4M7 172 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BORCS7Q96B45 105 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 AP1S3Q96PC3 154 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SMIM7Q9BQ49 75 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DPH3P1Q9H4G8 78 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NIT2Q9NQR4 276 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 OSTCQ9NRP0 149 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A087WWC5 75 aa3.31□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A1B0GXF2 115 aa3.31□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa3.31□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF727A8MUV8 499 aa3.31□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HIGD1CA8MV81 97 aa3.31□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 F2Z2F3 143 aa3.31□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SMIM17P0DL12 118 aa3.31□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SCXQ7RTU7 201 aa3.31□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SMIM15Q7Z3B0 74 aa3.31□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C15orf56Q8N910 161 aa3.31□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TSKUQ8WUA8 353 aa3.31□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM262E9PQX1 116 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ANGP03950 147 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM70Q9BUB7 260 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM191AQ9H0A3 160 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM242Q9NWH2 141 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SDHAF1A6NFY7 115 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 H7C1H1 209 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PSCAO43653 123 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRGC1P0CF51 173 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CHTF8P0CG12 524 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 S100A1P23297 94 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 REG3AQ06141 175 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ADIRFQ15847 76 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM241Q24JQ0 296 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SDIM1Q6ZPB5 146 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LINC00526Q96FQ7 95 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NAT8Q9UHE5 227 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A087WX48 190 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A1B0GUT8 65 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A8MWL6 223 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PPP1R2P9O14990 202 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NPYP01303 97 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HLA-DQA1P01909 254 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FGF6P10767 208 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM97Q5BJF2 176 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM104BQ5XKR9 115 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UQCC3Q6UW78 93 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 Q8N9L7 120 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM243Q9BU79 118 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LPAP08519 4548 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 S100A8P05109 93 aa3.27□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PKIAP61925 76 aa3.27□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RPL39P62891 51 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LRP2P98164 4655 aa3.27□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MIAQ16674 131 aa3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms