RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580713.1

TOP3A-210, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3A, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-210ENST00000580713 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.06□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 LINC01549A6NIU2 74 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 IFITM10A6NMD0 228 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 LEPROTL1O95214 131 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 TOMM6Q96B49 74 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 LRP2P98164 4655 aa7.04□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.04□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 TMEM243Q9BU79 118 aa7.04□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.04□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.03□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 UBE2L6O14933 153 aa7.03□□□□□ -1.28
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TOP3A-210ENST00000580713 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.03□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 H7C423 109 aa7.02□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 ATP5LO75964 103 aa7.02□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 TIRAPP58753 221 aa7.02□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.02□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.02□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 BAALCQ8WXS3 180 aa7.02□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.02□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 GAGE6Q13070 117 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 LELP1Q5T871 98 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 ERASQ7Z444 233 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 TIMM17AQ99595 171 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 FGF6P10767 208 aa7□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 KRTDAPP60985 99 aa7□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 Q6ZN92 141 aa7□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 TMEM141Q96I45 108 aa7□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 TIMM21Q9BVV7 248 aa7□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 SPANXA1Q9NS26 97 aa7□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 IGIPA6NJ69 53 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 TMEM262E9PQX1 116 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 C3orf79P0CE67 100 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 AKR1D1P51857 326 aa6.99□□□□□ -1.29
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TOP3A-210ENST00000580713 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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TOP3A-210ENST00000580713 TMEM101Q96IK0 257 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.98□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 H0Y8G0 127 aa6.98□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 PRSS1P07477 247 aa6.98□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 NPSP0C0P6 89 aa6.98□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.98□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.98□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.97□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 PET117Q6UWS5 81 aa6.97□□□□□ -1.29
TOP3A-210ENST00000580713 A0A087WX48 190 aa6.96□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 A0A1B0GUV1 79 aa6.96□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 RBX1P62877 108 aa6.96□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 PMVKQ15126 192 aa6.96□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 MPV17L2Q567V2 206 aa6.96□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 Q6ZRU5 148 aa6.96□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 Q6ZUT4 128 aa6.96□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 VCX2Q9H322 139 aa6.96□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 COX11Q9Y6N1 276 aa6.96□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 C20orf202A1L168 122 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 SCGB1D1O95968 90 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 FAM104AQ969W3 186 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 RMI2Q96E14 147 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 AMELXQ99217 191 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.94□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 C9orf118A6NHY6 69 aa6.94□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 LINC01545Q5VT33 79 aa6.94□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.94□□□□□ -1.3
TOP3A-210ENST00000580713 CST9LQ9H4G1 147 aa6.94□□□□□ -1.3
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