RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KRTAP10-8P60410 259 aa17.42■□□□□ 0.38
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa17.13■□□□□ 0.33
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRR26Q8N8Z3 221 aa17.13■□□□□ 0.33
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TOMM7Q9P0U1 55 aa17.08■□□□□ 0.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LPAP08519 4548 aa17.06■□□□□ 0.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CKS1BP61024 79 aa17.05■□□□□ 0.32
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 K7EMI3 77 aa17.03■□□□□ 0.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NPSP0C0P6 89 aa17.03■□□□□ 0.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C6orf226Q5I0X4 101 aa17.03■□□□□ 0.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CTDSP1Q9GZU7 261 aa17.02■□□□□ 0.32
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 Q8IZM0 81 aa17.01■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LINC00469Q8N7U9 141 aa17.01■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa16.99■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa16.99■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HERVK_113P63121 156 aa16.98■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SEC11AP67812 179 aa16.98■□□□□ 0.31
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