RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SPNS3-202ENST00000572078 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.95□□□□□ -0.98
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SPNS3-202ENST00000572078 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
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SPNS3-202ENST00000572078 A6NDN8 102 aa8.94□□□□□ -0.98
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