RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562291.2

INO80E-204, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 3

Gene INO80E, Length 255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-204ENST00000562291 VCYO14598 125 aa6.21□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 SERF1AO75920 110 aa6.21□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 SLPIP03973 132 aa6.21□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 PET117Q6UWS5 81 aa6.21□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.21□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 SMKR1H3BMG3 65 aa6.2□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 PPP1R17O96001 155 aa6.2□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 TSHBP01222 138 aa6.2□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 FCER1GP30273 86 aa6.2□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 SS18Q15532 418 aa6.2□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.2□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.19□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.19□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 PANO1I0J062 215 aa6.19□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 CAMPP49913 170 aa6.19□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.19□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 C15orf56Q8N910 161 aa6.19□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.19□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 A0A1B0GW15 77 aa6.18□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 CCL25O15444 150 aa6.18□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 XCL1P47992 114 aa6.18□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 LINC00310P59036 64 aa6.18□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.18□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 FOXI1Q12951 378 aa6.18□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.18□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 KIR2DL4Q99706 377 aa6.18□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.18□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 A0A087WYN8 130 aa6.17□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 IGLC3P0DOY3 106 aa6.17□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 CKS2P33552 79 aa6.17□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 COX6A2Q02221 97 aa6.17□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 SPATA45Q537H7 98 aa6.17□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 NRACQ8N912 160 aa6.17□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.16□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 NUPR1O60356 82 aa6.16□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 HSBP1O75506 76 aa6.16□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 OXTP01178 125 aa6.16□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 CHTF8P0CG12 524 aa6.16□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 KRTDAPP60985 99 aa6.16□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.16□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.16□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.16□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.15□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 MAJINQ3KP22 176 aa6.15□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.15□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.15□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 C20orf78Q9BR46 151 aa6.15□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.15□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.14□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 TNFRSF6BO95407 300 aa6.14□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 C3orf79P0CE67 100 aa6.14□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 MALP21145 153 aa6.14□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 HBBP68871 147 aa6.14□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 Q6ZN92 141 aa6.14□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.14□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.14□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.14□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.13□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 A0A1B0GXF2 115 aa6.13□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.13□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 C7orf33Q8WU49 177 aa6.13□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.13□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.13□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 D6R8Y8 96 aa6.12□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 COX7A2LO14548 114 aa6.12□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 PPBPP02775 128 aa6.12□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 G0S2P27469 103 aa6.12□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 SYCNQ0VAF6 134 aa6.12□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 STPG4Q8N801 248 aa6.12□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 CARD19Q96LW7 228 aa6.12□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.12□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.12□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 UBE2V1Q13404 147 aa6.11□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 C5orf38Q86SI9 138 aa6.11□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.11□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.11□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 MYCBP2O75592 4640 aa6.1□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.1□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 A0A096LNI7 61 aa6.1□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 APOMO95445 188 aa6.1□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 NPYP01303 97 aa6.1□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.1□□□□□ -1.43
INO80E-204ENST00000562291 Q6ZRU5 148 aa6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 165 ms