RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558593.1

GABPB1-AS1-203, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GABPB1-AS1, Length 507 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.69□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TRGV9Q99603 122 aa4.69□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa4.68□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SNRPGP15A8MWD9 76 aa4.68□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NDUFC1O43677 76 aa4.68□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TIMM17BO60830 172 aa4.68□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.68□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FXYD3Q14802 87 aa4.68□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.68□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NFE4Q86UQ8 179 aa4.68□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa4.68□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.67□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 C16orf90A8MZG2 172 aa4.67□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ACYP1P07311 99 aa4.67□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PTHLHP12272 177 aa4.67□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.67□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 REG3AQ06141 175 aa4.67□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 KISS1Q15726 138 aa4.67□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.67□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NMSQ5H8A3 153 aa4.67□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ORMDL3Q8N138 153 aa4.67□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SERP2Q8N6R1 65 aa4.67□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.67□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 Q9H3A6 140 aa4.67□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.67□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CYTL1Q9NRR1 136 aa4.67□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 V9GYH0 126 aa4.67□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa4.66□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa4.66□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NAP1L6A6NFF2 107 aa4.66□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 C2orf70A6NJV1 201 aa4.66□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SMIM13P0DJ93 91 aa4.66□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 WFDC2Q14508 124 aa4.66□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZNF497Q6ZNH5 498 aa4.66□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.66□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DEFB107AQ8IZN7 70 aa4.66□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DAND5Q8N907 189 aa4.66□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GTSF1Q8WW33 167 aa4.66□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CHCHD5Q9BSY4 110 aa4.66□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SCRT1Q9BWW7 348 aa4.66□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SDF2L1Q9HCN8 221 aa4.66□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 APLNQ9ULZ1 77 aa4.66□□□□□ -1.66
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 J3QLW9 94 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NDUFA3O95167 84 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NPPCP23582 126 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CKS2P33552 79 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CEND1Q8N111 149 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NPBQ8NG41 125 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LINC01600Q96MT4 127 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PRO0461Q9UI25 63 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZNF580Q9UK33 172 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 HHLA3Q9XRX5 114 aa4.65□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TRAV2A0A0B4J234 112 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LEPROTO15243 131 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FXYD7P58549 80 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TVP23CQ96ET8 276 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LINC00574Q9H8X3 128 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 BCE1O60756 84 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IGKV1-16P04430 117 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZNF137PP52743 207 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZNF79Q15937 498 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 C10orf55Q5SWW7 151 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.62□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.62□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa4.62□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 hADV29S1A0JD25 119 aa4.62□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MPV17LQ2QL34 196 aa4.62□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PYDC2Q56P42 97 aa4.62□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 Q6ZTC4 211 aa4.62□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 Q8N8P6 123 aa4.62□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.61□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.61□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 K7ERS5 55 aa4.61□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.61□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PATE2Q6UY27 113 aa4.61□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.61□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SH2D6Q7Z4S9 175 aa4.61□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 F2Z2F3 143 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NUPR1O60356 82 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 HTN3P15516 51 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SS18Q15532 418 aa4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms