RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557356.5

PSEN1-222, Transcript of presenilin 1, human

TSL 4

Gene PSEN1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSEN1-222	ENST00000557356		Q6ZN92	141 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC00587	B1AMM8	73 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	TSTD3	H0UI37	97 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	COX7A2L	O14548	114 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	DPH3	Q96FX2	82 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356		F8WDY8	70 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	FABP4	P15090	132 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	SEC11A	P67812	179 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	TMEM141	Q96I45	108 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	VCX2	Q9H322	139 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSEN1-222	ENST00000557356		Q6ZUT4	128 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	C15orf56	Q8N910	161 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	SYCN	Q0VAF6	134 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC01620	Q4KN68	170 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	FA2H	Q7L5A8	372 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	C2orf48	Q96LS8	159 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356		Q5VSD8	79 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	SCX	Q7RTU7	201 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	ERAS	Q7Z444	233 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	C5orf38	Q86SI9	138 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	TOMM6	Q96B49	74 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	TIMM17A	Q99595	171 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC01546	A6NGU7	62 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	IGIP	A6NJ69	53 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	SLPI	P03973	132 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	DDT	P30046	118 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	RNF151	Q2KHN1	245 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	CARD19	Q96LW7	228 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	AMELX	Q99217	191 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356		A0A087WZ39	114 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	UBE2D1	P51668	147 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	HERVK_113	P63121	156 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	COX6A2	Q02221	97 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	NDUFA1	O15239	70 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC00614	P0C842	121 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	SPAG11B	Q08648	103 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM104A	Q969W3	186 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSEN1-222	ENST00000557356	PRSS2	P07478	247 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	HAMP	P81172	84 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	MAJIN	Q3KP22	176 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	C7orf33	Q8WU49	177 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	C14orf144	Q96I85	54 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356		A0A087WYN8	130 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	ATP5L	O75964	103 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	CKS1B	P61024	79 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	PMVK	Q15126	192 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	BAGE3	Q86Y29	109 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		5	□□□□□ -1.61

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