RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555887.5

PSMC6-211, Transcript of proteasome 26S subunit, ATPase 6, human

TSL 2

Gene PSMC6, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMC6-211	ENST00000555887	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	CCL25	O15444	150 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	NUPR1	O60356	82 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	SERF1A	O75920	110 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	WFDC2	Q14508	124 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887		A0A096LNJ9	63 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	HSBP1	O75506	76 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	HBD	P02042	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	XG	P55808	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	NDUFA6	P56556	154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887		Q5VSD8	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887		Q6ZN92	141 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMC6-211	ENST00000555887	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	LINC00310	P59036	64 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	FOXI1	Q12951	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887		Q6ZSA8	131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	FABP4	P15090	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	COX6A2	Q02221	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	AMELX	Q99217	191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887		A0A0J9YXV3	536 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	ATP5L	O75964	103 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	PRSS1	P07477	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	NPS	P0C0P6	89 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	MAL	P21145	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	UBE2D1	P51668	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	PMVK	Q15126	192 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887		H0Y8G0	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	COX7A2L	O14548	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMC6-211	ENST00000555887		A0A087WZ39	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMC6-211	ENST00000555887	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMC6-211	ENST00000555887	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMC6-211	ENST00000555887	APOM	O95445	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMC6-211	ENST00000555887	OXT	P01178	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMC6-211	ENST00000555887	HERVK_113	P63121	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMC6-211	ENST00000555887	SEC11A	P67812	179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMC6-211	ENST00000555887	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMC6-211	ENST00000555887	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMC6-211	ENST00000555887	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMC6-211	ENST00000555887	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMC6-211	ENST00000555887	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMC6-211	ENST00000555887	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMC6-211	ENST00000555887	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms