RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	COX6A2	Q02221	97 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM141	Q96I45	108 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	SVBP	Q8N300	66 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	IGIP	A6NJ69	53 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985		K7EMI3	77 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	SNAPIN	O95295	136 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	MT-ND6	P03923	174 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	SYCN	Q0VAF6	134 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	NDUFA5	Q16718	116 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	COX19	Q49B96	90 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985	CARD19	Q96LW7	228 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A087WYN8	130 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A096LNI7	61 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	UBE2D1	P51668	147 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985		Q6ZRU5	148 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	TOMM6	Q96B49	74 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	AMELX	Q99217	191 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	LINC01546	A6NGU7	62 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	SPAG11B	Q08648	103 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	DPH3	Q96FX2	82 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	MYCBP2	O75592	4640 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	APOM	O95445	188 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	MAJIN	Q3KP22	176 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985		Q6ZN92	141 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	YPEL4	Q96NS1	127 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	VCX2	Q9H322	139 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A087WZ39	114 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	NPS	P0C0P6	89 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	C2orf48	Q96LS8	159 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	TIMM17A	Q99595	171 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A0J9YXV3	536 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	G0S2	P27469	103 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	C10orf25	Q5T742	122 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	FA2H	Q7L5A8	372 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	ERAS	Q7Z444	233 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	KIAA0087	Q14695	138 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985	STPG4	Q8N801	248 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A096LNJ9	63 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	PTTG1IP	P53801	180 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	GAGE2B	Q13066	116 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985		F8WDY8	70 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	NDUFA1	O15239	70 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	PMCHL1	Q16048	86 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	RNF151	Q2KHN1	245 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	C2orf82	Q6UX34	121 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	CST9L	Q9H4G1	147 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	LINC01549	A6NIU2	74 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	LINC00614	P0C842	121 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	HERVK_113	P63121	156 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A1W2PNN7	141 aa		7.04	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	SEC11A	P67812	179 aa		7.04	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		7.03	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985	PMVK	Q15126	192 aa		7.03	□□□□□ -1.28
TPCN1-223	ENST00000552985		Q6ZRP5	223 aa		7.03	□□□□□ -1.28

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