RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 NRACQ8N912 160 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 TSKUQ8WUA8 353 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 LCE3BQ5TA77 95 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 FAM104AQ969W3 186 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 KIR2DL4Q99706 377 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 FAM210AQ96ND0 272 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 CT83Q5H943 113 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 C2orf82Q6UX34 121 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 IFITM10A6NMD0 228 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 TMEM18Q96B42 140 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 TMEM250H0YL14 139 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 RIGQ13278 110 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 MUC17Q685J3 4493 aa9.52□□□□□ -0.88
CS-227ENST00000551441 KIAA0087Q14695 138 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 LINC01551Q86U37 167 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 SLC51BQ86UW2 128 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 F8WDY8 70 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 A0A087X002 238 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 PPP1R2P9O14990 202 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 TCAPO15273 167 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 ZNF861PO60384 105 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 PPP1R17O96001 155 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 HBBP68871 147 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 OSTCQ9NRP0 149 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 V9GYV3 84 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 CKS2P33552 79 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 ZNF727A8MUV8 499 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 TNFRSF6BO95407 300 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 C22orf24Q9Y442 160 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-227ENST00000551441 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 C20orf78Q9BR46 151 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 D6R8Y8 96 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 NPYP01303 97 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 BLOC1S1P78537 153 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 LINC00862A6NCI5 91 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 NUPR1O60356 82 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 CRYGAP11844 174 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 TCTE3Q8IZS6 198 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 ADIRFQ15847 76 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-227ENST00000551441 PRSS2P07478 247 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-227ENST00000551441 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-227ENST00000551441 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-227ENST00000551441 CDIP1Q9H305 208 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-227ENST00000551441 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-227ENST00000551441 BCE1O60756 84 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-227ENST00000551441 RAB5AP20339 215 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-227ENST00000551441 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-227ENST00000551441 CKS1BP61024 79 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-227ENST00000551441 TMEM141Q96I45 108 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-227ENST00000551441 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-227ENST00000551441 GAGE10A6NGK3 116 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-227ENST00000551441 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-227ENST00000551441 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-227ENST00000551441 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
CS-227ENST00000551441 Q6ZN92 141 aa9.35□□□□□ -0.91
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