RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550446.5

LETMD1-224, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 562 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-224	ENST00000550446	MT-ND6	P03923	174 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446	TMEM18	Q96B42	140 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446	SPAG11B	Q08648	103 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LETMD1-224	ENST00000550446	NDUFA5	Q16718	116 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-224	ENST00000550446	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-224	ENST00000550446	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-224	ENST00000550446	CKS2	P33552	79 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-224	ENST00000550446	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-224	ENST00000550446	C1orf137	Q5JT78	98 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-224	ENST00000550446	C20orf78	Q9BR46	151 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-224	ENST00000550446	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-224	ENST00000550446	RNF151	Q2KHN1	245 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-224	ENST00000550446	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-224	ENST00000550446	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-224	ENST00000550446	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-224	ENST00000550446	TNFRSF6B	O95407	300 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-224	ENST00000550446	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM104A	Q969W3	186 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LETMD1-224	ENST00000550446		A0A1B0GW15	77 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	TCAP	O15273	167 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	APOC3	P02656	99 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	IMMP2L	Q96T52	175 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		11.57	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446		D6R8Y8	96 aa		11.57	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	C10orf25	Q5T742	122 aa		11.57	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		11.57	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		11.57	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		11.57	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446		A0A087WZ39	114 aa		11.56	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM168B	A1KXE4	195 aa		11.56	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	IFITM10	A6NMD0	228 aa		11.56	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	NDUFA1	O15239	70 aa		11.56	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446		F8WDY8	70 aa		11.55	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	MT-ND4L	P03901	98 aa		11.55	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	HBB	P68871	147 aa		11.55	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	NPY	P01303	97 aa		11.54	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	IGLV7-43	P04211	117 aa		11.54	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	GAGE2E	Q4V326	116 aa		11.54	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	DIRC1	Q969H9	104 aa		11.54	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		11.54	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		11.54	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	S100A8	P05109	93 aa		11.53	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	RHEB	Q15382	184 aa		11.53	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		11.53	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		11.53	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		11.53	□□□□□ -0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	SVBP	Q8N300	66 aa		11.52	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	RAB5A	P20339	215 aa		11.51	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		11.51	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		11.51	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	LPA	P08519	4548 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	SNAPIN	O95295	136 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	PPBP	P02775	128 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446		A0A1B0GXF2	115 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446		H0Y9J4	135 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	ATP6V1G1	O75348	118 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	KIAA0087	Q14695	138 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	ORMDL3	Q8N138	153 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	PRELID3A	Q96N28	172 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	C2orf82	Q6UX34	121 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	UBE2B	P63146	152 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		11.45	□□□□□ -0.58
LETMD1-224	ENST00000550446		M0QXV9	152 aa		11.45	□□□□□ -0.58
LETMD1-224	ENST00000550446	TMEM141	Q96I45	108 aa		11.44	□□□□□ -0.58
LETMD1-224	ENST00000550446	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
LETMD1-224	ENST00000550446	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LETMD1-224	ENST00000550446	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LETMD1-224	ENST00000550446	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LETMD1-224	ENST00000550446	YPEL4	Q96NS1	127 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LETMD1-224	ENST00000550446	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LETMD1-224	ENST00000550446	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LETMD1-224	ENST00000550446	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-224	ENST00000550446	UBE2D1	P51668	147 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-224	ENST00000550446	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-224	ENST00000550446	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-224	ENST00000550446	SCO1	O75880	301 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-224	ENST00000550446	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-224	ENST00000550446	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-224	ENST00000550446	VCX2	Q9H322	139 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-224	ENST00000550446	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	PRSS47	A8MTI9	375 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	PRSS2	P07478	247 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	S100P	P25815	95 aa		11.38	□□□□□ -0.59

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