RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 PRELID3AQ96N28 172 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 TCAPO15273 167 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 LINC01620Q4KN68 170 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 TMEM101Q96IK0 257 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 IMMP2LQ96T52 175 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 PHOX2AO14813 284 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 APOC3P02656 99 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 PRSS1P07477 247 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 S100PP25815 95 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 RAB5AP20339 215 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 C14orf177Q52M58 125 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 CCL25O15444 150 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 XCL1P47992 114 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 RHEBQ15382 184 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 SS18Q15532 418 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 hDV102S1A0JD36 115 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 ATP6V1G1O75348 118 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 Q6ZUT4 128 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 SNAPINO95295 136 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 FOXI1Q12951 378 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 NDUFA5Q16718 116 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 Q8N8P6 123 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 SVBPQ8N300 66 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 C15orf56Q8N910 161 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 FAM104AQ969W3 186 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-217ENST00000550044 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 LRP2P98164 4655 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 COX19Q49B96 90 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 Q6ZSA8 131 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 C5orf38Q86SI9 138 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 IFITM10A6NMD0 228 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 OXTP01178 125 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 MT-ND6P03923 174 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 K7EMI3 77 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 COX7A2LO14548 114 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 SCXQ7RTU7 201 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 DPH3Q96FX2 82 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 TMEM141Q96I45 108 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 IGIPA6NJ69 53 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 PANO1I0J062 215 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-217ENST00000550044 COX6A2Q02221 97 aa6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms