RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545436.5

LMO3-232, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 530 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-232ENST00000545436 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 C11orf86A6NJI1 115 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 H0Y8G0 127 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 SCGB1D1O95968 90 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 SMIM6P0DI80 62 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 Q8N3U1 123 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.35□□□□□ -1.07
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LMO3-232ENST00000545436 A0A0J9YXV3 536 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.34□□□□□ -1.07
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LMO3-232ENST00000545436 LY6G6CO95867 125 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 HERVK_113P61574 105 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 Q6ZR54 194 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.34□□□□□ -1.07
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LMO3-232ENST00000545436 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.33□□□□□ -1.08
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LMO3-232ENST00000545436 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.32□□□□□ -1.08
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LMO3-232ENST00000545436 XCL1P47992 114 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 CFAP161Q6P656 301 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.32□□□□□ -1.08
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LMO3-232ENST00000545436 F8WDY8 70 aa8.31□□□□□ -1.08
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LMO3-232ENST00000545436 PYY3Q5JQD4 70 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.31□□□□□ -1.08
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LMO3-232ENST00000545436 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 C6orf223Q8N319 242 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.3□□□□□ -1.08
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LMO3-232ENST00000545436 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 TMEM223A0PJW6 202 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 E9PLD3 99 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 S100A12P80511 92 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 C14orf177Q52M58 125 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 Q9HAA7 133 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 CXCL5P42830 114 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 COX6A2Q02221 97 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-232ENST00000545436 VAMP8Q9BV40 100 aa8.28□□□□□ -1.08
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LMO3-232ENST00000545436 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.27□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 PSCAO43653 123 aa8.27□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 NMUP48645 174 aa8.27□□□□□ -1.09
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LMO3-232ENST00000545436 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.26□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 LEPROTO15243 131 aa8.26□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.26□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 C5orf38Q86SI9 138 aa8.25□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 C2orf48Q96LS8 159 aa8.25□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 PRSS2P07478 247 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 LINC00587B1AMM8 73 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 SPINK8P0C7L1 97 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 ATOH7Q8N100 152 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 COX7B2Q8TF08 81 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 J3QQQ9 107 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 DLEU1O43261 78 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 HERV-K104P63124 156 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-232ENST00000545436 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.22□□□□□ -1.09
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LMO3-232ENST00000545436 M0R2N4 97 aa8.21□□□□□ -1.1
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LMO3-232ENST00000545436 SPAG11BQ08648 103 aa8.21□□□□□ -1.1
LMO3-232ENST00000545436 C15orf56Q8N910 161 aa8.21□□□□□ -1.1
LMO3-232ENST00000545436 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-232ENST00000545436 USP17L23D6RBM5 183 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-232ENST00000545436 NDUFA1O15239 70 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-232ENST00000545436 GCSHP23434 173 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-232ENST00000545436 CKS1BP61024 79 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-232ENST00000545436 KIAA0087Q14695 138 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-232ENST00000545436 SPATA45Q537H7 98 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-232ENST00000545436 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-232ENST00000545436 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-232ENST00000545436 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-232ENST00000545436 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
LMO3-232ENST00000545436 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-232ENST00000545436 RNF151Q2KHN1 245 aa8.19□□□□□ -1.1
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