RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 FAM236CP0DP71 79 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 CELA1Q9UNI1 258 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 Q6ZQY7 126 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRB-204ENST00000538708 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.76□□□□□ -1.33
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PTPRB-204ENST00000538708 FAM229AH3BQW9 127 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 TIMM17BO60830 172 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 WFDC2Q14508 124 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 PIEZO1Q92508 2521 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 XGP55808 180 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 MUC7Q8TAX7 377 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRB-204ENST00000538708 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 F8WDY8 70 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 TRIAP1O43715 76 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 ENHOQ6UWT2 76 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRB-204ENST00000538708 TAX1BP3O14907 124 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 LINC00694P0DN24 101 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 GAS8-AS1O95177 125 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTPRB-204ENST00000538708 LST1O00453 97 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 C16orf90A8MZG2 172 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 Q6ZSN1 163 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 Q6ZVQ6 151 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-204ENST00000538708 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 Q9BRP9 147 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 C2orf48Q96LS8 159 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 TTC28Q96AY4 2481 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 K7ERS5 55 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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PTPRB-204ENST00000538708 LIMD2Q9BT23 127 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRB-204ENST00000538708 LINC00643Q86TS7 51 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRB-204ENST00000538708 J3QL48 77 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 PRYO14603 147 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRB-204ENST00000538708 PRR15LQ9BU68 103 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 Q6ZRU5 148 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1B0GUV1 79 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 EML5Q05BV3 1969 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 RTL8CO15255 209 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 IGIPA6NJ69 53 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 CNFNQ9BYD5 112 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 MED13LQ71F56 2210 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 Q6JHZ5 121 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 B5MCH6 92 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-204ENST00000538708 X6R8D5 127 aa6.65□□□□□ -1.34
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PTPRB-204ENST00000538708 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.65□□□□□ -1.35
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PTPRB-204ENST00000538708 LINC00315P59091 139 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 C22orf24Q9Y442 160 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 Q8N9L7 120 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 Q6Q795 121 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 Q8N814 137 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 ACACBO00763 2458 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 PLCE1Q9P212 2302 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-204ENST00000538708 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.61□□□□□ -1.35
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