RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527744.5

PUF60-211, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 2

Gene PUF60, Length 1,007 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-211ENST00000527744 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.49□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.49□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.49□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 NDUFA1O15239 70 aa7.49□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 ADIRFQ15847 76 aa7.49□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 GAGE2EQ4V326 116 aa7.49□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
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PUF60-211ENST00000527744 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.49□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.49□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.49□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
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PUF60-211ENST00000527744 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.48□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 LINC01551Q86U37 167 aa7.48□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.48□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 ST20Q9HBF5 79 aa7.48□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.47□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.47□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 K7EN84 100 aa7.47□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 PPP1R2P9O14990 202 aa7.47□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 CT83Q5H943 113 aa7.47□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 COMMD7Q86VX2 200 aa7.47□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 OSTCQ9NRP0 149 aa7.47□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.47□□□□□ -1.21
PUF60-211ENST00000527744 C9JQL5 133 aa7.45□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 F8W036 122 aa7.45□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 NUPR1O60356 82 aa7.45□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 MT-ND4LP03901 98 aa7.45□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 Q6ZUT4 128 aa7.45□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.44□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 LINC00862A6NCI5 91 aa7.44□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 NDUFA5Q16718 116 aa7.44□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.44□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 TMEM218A2RU14 115 aa7.43□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.43□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 RIGQ13278 110 aa7.43□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.43□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.43□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.43□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.43□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.42□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.42□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.42□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.42□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 A0A1B0GUT8 65 aa7.41□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 HIGD1CA8MV81 97 aa7.41□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 VCYO14598 125 aa7.41□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 S100A8P05109 93 aa7.41□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 FCER1GP30273 86 aa7.41□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 KIAA0087Q14695 138 aa7.41□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 SEC11CQ9BY50 192 aa7.41□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.41□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.4□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 A0A1B0GW15 77 aa7.4□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 FAM104AQ969W3 186 aa7.4□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.4□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 V9GYV3 84 aa7.4□□□□□ -1.22
PUF60-211ENST00000527744 RAB4AP20338 218 aa7.39□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.39□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.39□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 C22orf24Q9Y442 160 aa7.39□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 BCE1O60756 84 aa7.38□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 S100PP25815 95 aa7.38□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 CTAG1AP78358 180 aa7.38□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 C2orf82Q6UX34 121 aa7.38□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.38□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.37□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.37□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 KIR2DL4Q99706 377 aa7.37□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 SMKR1H3BMG3 65 aa7.36□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 PPP1R17O96001 155 aa7.36□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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PUF60-211ENST00000527744 NRACQ8N912 160 aa7.36□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 TMEM18Q96B42 140 aa7.36□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 SNAPINO95295 136 aa7.35□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 HBBP68871 147 aa7.35□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 RHEBQ15382 184 aa7.35□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 AMN1Q8IY45 258 aa7.35□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 APOC3P02656 99 aa7.34□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.34□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.34□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.34□□□□□ -1.23
PUF60-211ENST00000527744 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.33□□□□□ -1.24
PUF60-211ENST00000527744 IFITM10A6NMD0 228 aa7.33□□□□□ -1.24
PUF60-211ENST00000527744 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PUF60-211ENST00000527744 LCE2CQ5TA81 110 aa7.33□□□□□ -1.24
PUF60-211ENST00000527744 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PUF60-211ENST00000527744 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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