RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 CBLN2Q8IUK8 224 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 AMN1Q8IY45 258 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 ST20Q9HBF5 79 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 MALP21145 153 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 CKS2P33552 79 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 ORMDL3Q8N138 153 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 YPEL4Q96NS1 127 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 COX7A2LO14548 114 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.84□□□□□ -0.83
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PTPRU-210ENST00000527027 C1orf137Q5JT78 98 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRU-210ENST00000527027 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRU-210ENST00000527027 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRU-210ENST00000527027 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRU-210ENST00000527027 C2orf48Q96LS8 159 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRU-210ENST00000527027 C20orf78Q9BR46 151 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRU-210ENST00000527027 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRU-210ENST00000527027 COLCA2A8K830 154 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRU-210ENST00000527027 TCAPO15273 167 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRU-210ENST00000527027 SCO1O75880 301 aa9.81□□□□□ -0.84
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PTPRU-210ENST00000527027 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRU-210ENST00000527027 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRU-210ENST00000527027 D6R8Y8 96 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRU-210ENST00000527027 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRU-210ENST00000527027 PRELID3AQ96N28 172 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRU-210ENST00000527027 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRU-210ENST00000527027 VCYO14598 125 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRU-210ENST00000527027 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRU-210ENST00000527027 C5orf38Q86SI9 138 aa9.79□□□□□ -0.84
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PTPRU-210ENST00000527027 IGLV7-43P04211 117 aa9.78□□□□□ -0.84
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PTPRU-210ENST00000527027 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.78□□□□□ -0.84
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PTPRU-210ENST00000527027 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRU-210ENST00000527027 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.78□□□□□ -0.84
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PTPRU-210ENST00000527027 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.77□□□□□ -0.85
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PTPRU-210ENST00000527027 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
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PTPRU-210ENST00000527027 NPYP01303 97 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRU-210ENST00000527027 TRGC2P03986 189 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRU-210ENST00000527027 G0S2P27469 103 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRU-210ENST00000527027 RAB5BP61020 215 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRU-210ENST00000527027 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRU-210ENST00000527027 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRU-210ENST00000527027 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRU-210ENST00000527027 Q6ZUT4 128 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRU-210ENST00000527027 Q8N8P6 123 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRU-210ENST00000527027 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRU-210ENST00000527027 FAM168BA1KXE4 195 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM18Q96B42 140 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 LINC01549A6NIU2 74 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 ORMDL2Q53FV1 153 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 NDUFA1O15239 70 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 C10orf25Q5T742 122 aa9.69□□□□□ -0.86
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PTPRU-210ENST00000527027 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.68□□□□□ -0.86
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PTPRU-210ENST00000527027 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 BAGE3Q86Y29 109 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 LINC00614P0C842 121 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 UBE2D1P51668 147 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 GAGE2EQ4V326 116 aa9.66□□□□□ -0.86
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