RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525358.1

EDRF1-210, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene EDRF1, Length 436 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1-210ENST00000525358 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.27□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.27□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.27□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 C16orf90A8MZG2 172 aa7.26□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 KRTAP10-2P60368 255 aa7.26□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 KRTDAPP60985 99 aa7.26□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.26□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.26□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.26□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.26□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.25□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 LECT2O14960 151 aa7.25□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 G0S2P27469 103 aa7.25□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 C14orf177Q52M58 125 aa7.25□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 SPATA45Q537H7 98 aa7.25□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.25□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.25□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.24□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 WFDC2Q14508 124 aa7.24□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 SS18Q15532 418 aa7.24□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.24□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.24□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.24□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.24□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.24□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.23□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.23□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.23□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 CCL25O15444 150 aa7.23□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 DLEU1O43261 78 aa7.23□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.23□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.23□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.23□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 USP17L23D6RBM5 183 aa7.22□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 NUPR1O60356 82 aa7.22□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 C3orf79P0CE67 100 aa7.22□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 IGLC3P0DOY3 106 aa7.22□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 LINC00310P59036 64 aa7.22□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.22□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.22□□□□□ -1.25
EDRF1-210ENST00000525358 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 GCSHP23434 173 aa7.21□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 CFAP161Q6P656 301 aa7.21□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.21□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 Q6ZN92 141 aa7.21□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 Q6ZUT4 128 aa7.21□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.21□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 LINC01546A6NGU7 62 aa7.2□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 LINC01549A6NIU2 74 aa7.2□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 XCL1P47992 114 aa7.2□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.2□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 FA2HQ7L5A8 372 aa7.2□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.2□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.19□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 LEPROTL1O95214 131 aa7.19□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 NPSP0C0P6 89 aa7.19□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 FOXI1Q12951 378 aa7.19□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 TMEM141Q96I45 108 aa7.19□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.18□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 PRSS1P07477 247 aa7.18□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.18□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 FAM104AQ969W3 186 aa7.18□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 TOMM6Q96B49 74 aa7.18□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 VCX2Q9H322 139 aa7.18□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 hDV102S1A0JD36 115 aa7.17□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 IGIPA6NJ69 53 aa7.17□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 ERASQ7Z444 233 aa7.17□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.17□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 TIMM17AQ99595 171 aa7.17□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.16□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.16□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 KRTAP10-1P60331 282 aa7.16□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.16□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.16□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 COX7A2LO14548 114 aa7.15□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 CDK2AP2O75956 126 aa7.15□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 MALP21145 153 aa7.15□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 C15orf56Q8N910 161 aa7.15□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.15□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 AMELXQ99217 191 aa7.15□□□□□ -1.26
EDRF1-210ENST00000525358 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
EDRF1-210ENST00000525358 APOMO95445 188 aa7.14□□□□□ -1.27
EDRF1-210ENST00000525358 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
EDRF1-210ENST00000525358 BATFQ16520 125 aa7.14□□□□□ -1.27
EDRF1-210ENST00000525358 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.14□□□□□ -1.27
EDRF1-210ENST00000525358 C5orf38Q86SI9 138 aa7.14□□□□□ -1.27
EDRF1-210ENST00000525358 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms