RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524152.5

MSC-AS1-210, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene MSC-AS1, Length 571 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-210ENST00000524152 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 C20orf78Q9BR46 151 aa5.78□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
MSC-AS1-210ENST00000524152 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.77□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa5.77□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 LINC00862A6NCI5 91 aa5.77□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 TCAPO15273 167 aa5.77□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 CKS2P33552 79 aa5.77□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.77□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 IMMP2LQ96T52 175 aa5.77□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.76□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 A0A1B0GW15 77 aa5.76□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.76□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 F8WDY8 70 aa5.76□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 NDUFA1O15239 70 aa5.76□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.76□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.76□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 DIRC1Q969H9 104 aa5.76□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM104AQ969W3 186 aa5.76□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.76□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 A0A087WZ39 114 aa5.75□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM168BA1KXE4 195 aa5.75□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 IFITM10A6NMD0 228 aa5.75□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 TNFRSF6BO95407 300 aa5.75□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGLV7-43P04211 117 aa5.75□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 ADIRFQ15847 76 aa5.75□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 C10orf25Q5T742 122 aa5.75□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.75□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 D6R8Y8 96 aa5.74□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.74□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 HBBP68871 147 aa5.74□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.74□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.74□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 A0A1B0GVG6 124 aa5.73□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 F8W036 122 aa5.73□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 H0Y9J4 135 aa5.73□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 S100A8P05109 93 aa5.73□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.73□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.73□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.73□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 NAT8Q9UHE5 227 aa5.73□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa5.72□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 C9JQL5 133 aa5.72□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 NPYP01303 97 aa5.72□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 PPBPP02775 128 aa5.72□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 GAGE2EQ4V326 116 aa5.72□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.72□□□□□ -1.49
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.71□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 A0A1B0GXF2 115 aa5.71□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 M0QXV9 152 aa5.71□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 RAB5AP20339 215 aa5.71□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 KIAA0087Q14695 138 aa5.71□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.71□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.7□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.7□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.7□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 UBE2BP63146 152 aa5.7□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.7□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 ORMDL3Q8N138 153 aa5.7□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.7□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.69□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.69□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 PEA15Q15121 130 aa5.69□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.69□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 C2orf82Q6UX34 121 aa5.69□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.69□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 TMEM141Q96I45 108 aa5.69□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 UBE2D1P51668 147 aa5.68□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 LCE2CQ5TA81 110 aa5.68□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.68□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa5.68□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 PRELID3AQ96N28 172 aa5.68□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.67□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 C2orf88Q9BSF0 95 aa5.67□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.66□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 Q6ZN92 141 aa5.66□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.66□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 PRSS47A8MTI9 375 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZNF861PO60384 105 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 PRSS2P07478 247 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 CKS1BP61024 79 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 PRR4Q16378 134 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 VCX2Q9H322 139 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms