RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514834.1

ITGA3-214, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ITGA3, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-214ENST00000514834 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGA3-214ENST00000514834 HBDP02042 147 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGA3-214ENST00000514834 RBX1P62877 108 aa9.12□□□□□ -0.95
ITGA3-214ENST00000514834 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
ITGA3-214ENST00000514834 PRR34Q9NV39 138 aa9.11□□□□□ -0.95
ITGA3-214ENST00000514834 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.11□□□□□ -0.95
ITGA3-214ENST00000514834 COX11Q9Y6N1 276 aa9.11□□□□□ -0.95
ITGA3-214ENST00000514834 H7C423 109 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA3-214ENST00000514834 M0R143 59 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA3-214ENST00000514834 ATP5LO75964 103 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA3-214ENST00000514834 NPSP0C0P6 89 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA3-214ENST00000514834 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA3-214ENST00000514834 RMI2Q96E14 147 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA3-214ENST00000514834 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.1□□□□□ -0.95
ITGA3-214ENST00000514834 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA3-214ENST00000514834 EPM2AB3EWF7 344 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA3-214ENST00000514834 UBE2L6O14933 153 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA3-214ENST00000514834 TSHBP01222 138 aa9.09□□□□□ -0.95
ITGA3-214ENST00000514834 CRPP02741 224 aa9.08□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 MIAQ16674 131 aa9.08□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.08□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.08□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.08□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.07□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 Q5VSD8 79 aa9.07□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.07□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.07□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 IGLC3P0DOY3 106 aa9.06□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 LINC01545Q5VT33 79 aa9.06□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 Q6ZN92 141 aa9.06□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 TMEM141Q96I45 108 aa9.06□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 FGF6P10767 208 aa9.05□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 REG3AQ06141 175 aa9.05□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.05□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 Q6ZSA8 131 aa9.05□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 ERASQ7Z444 233 aa9.05□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 TOMM6Q96B49 74 aa9.05□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 TMEM101Q96IK0 257 aa9.05□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.05□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.05□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.04□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 USP17L23D6RBM5 183 aa9.04□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.04□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.04□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 ATOH7Q8N100 152 aa9.04□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.04□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 TIMM17AQ99595 171 aa9.04□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.04□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.04□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.04□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.03□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.03□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
ITGA3-214ENST00000514834 H0Y8G0 127 aa9.02□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 PRSS1P07477 247 aa9.02□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.01□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 A0A096LNJ9 63 aa9□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 SNHG12Q9BXW3 62 aa9□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 VCX2Q9H322 139 aa9□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 SEC11AP67812 179 aa8.99□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 SCXQ7RTU7 201 aa8.99□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.99□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 MYCBP2O75592 4640 aa8.98□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 CCL25O15444 150 aa8.98□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 HERC1Q15751 4861 aa8.98□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.97□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.97□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 hDV102S1A0JD36 115 aa8.97□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 FAM229AH3BQW9 127 aa8.97□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 C14orf177Q52M58 125 aa8.97□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.97□□□□□ -0.97
ITGA3-214ENST00000514834 SLPIP03973 132 aa8.96□□□□□ -0.98
ITGA3-214ENST00000514834 PLNP26678 52 aa8.96□□□□□ -0.98
ITGA3-214ENST00000514834 PMVKQ15126 192 aa8.96□□□□□ -0.98
ITGA3-214ENST00000514834 MAJINQ3KP22 176 aa8.96□□□□□ -0.98
ITGA3-214ENST00000514834 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.96□□□□□ -0.98
ITGA3-214ENST00000514834 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-214ENST00000514834 IGIPA6NJ69 53 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-214ENST00000514834 PANO1I0J062 215 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-214ENST00000514834 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-214ENST00000514834 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-214ENST00000514834 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGA3-214ENST00000514834 A0A1B0GV90 55 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-214ENST00000514834 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-214ENST00000514834 DPM2O94777 84 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-214ENST00000514834 COX8AP10176 69 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-214ENST00000514834 BATFQ16520 125 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-214ENST00000514834 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-214ENST00000514834 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ITGA3-214ENST00000514834 IGKCP01834 107 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms