RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512553.5

ITGA3-213, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-213ENST00000512553 IFITM10A6NMD0 228 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGA3-213ENST00000512553 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
ITGA3-213ENST00000512553 REG3GQ6UW15 175 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGA3-213ENST00000512553 Q6ZRP5 223 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGA3-213ENST00000512553 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGA3-213ENST00000512553 PRELID3AQ96N28 172 aa5.91□□□□□ -1.46
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ITGA3-213ENST00000512553 NDUFA1O15239 70 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGA3-213ENST00000512553 NPYP01303 97 aa5.9□□□□□ -1.46
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ITGA3-213ENST00000512553 IMMP2LQ96T52 175 aa5.9□□□□□ -1.46
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ITGA3-213ENST00000512553 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
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ITGA3-213ENST00000512553 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.88□□□□□ -1.47
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ITGA3-213ENST00000512553 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.88□□□□□ -1.47
ITGA3-213ENST00000512553 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
ITGA3-213ENST00000512553 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.87□□□□□ -1.47
ITGA3-213ENST00000512553 Q8N8P6 123 aa5.87□□□□□ -1.47
ITGA3-213ENST00000512553 A0A087WZ39 114 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGA3-213ENST00000512553 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGA3-213ENST00000512553 MT1HL1P0DM35 61 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGA3-213ENST00000512553 SEC11AP67812 179 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGA3-213ENST00000512553 LINC01600Q96MT4 127 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGA3-213ENST00000512553 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
ITGA3-213ENST00000512553 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGA3-213ENST00000512553 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGA3-213ENST00000512553 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGA3-213ENST00000512553 LINC01549A6NIU2 74 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGA3-213ENST00000512553 MT-ND6P03923 174 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGA3-213ENST00000512553 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
ITGA3-213ENST00000512553 CLLU1Q5K131 121 aa5.85□□□□□ -1.47
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ITGA3-213ENST00000512553 CTDSP1Q9GZU7 261 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGA3-213ENST00000512553 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.85□□□□□ -1.47
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ITGA3-213ENST00000512553 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.84□□□□□ -1.47
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ITGA3-213ENST00000512553 VCX2Q9H322 139 aa5.84□□□□□ -1.47
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ITGA3-213ENST00000512553 A0A1W2PNN7 141 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 HERVK_113P63121 156 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 COX19Q49B96 90 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 AMELXQ99217 191 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 TIMM17AQ99595 171 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 CXCL5P42830 114 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 CKS1BP61024 79 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.81□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 C1orf137Q5JT78 98 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 DIRC1Q969H9 104 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 TNXBP22105 4242 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 KIAA0087Q14695 138 aa5.8□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 ODF1Q14990 250 aa5.8□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 Q8IZM0 81 aa5.8□□□□□ -1.48
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ITGA3-213ENST00000512553 M0QXV9 152 aa5.79□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 UBE2BP63146 152 aa5.79□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 GAGE2EQ4V326 116 aa5.79□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.79□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 C10orf25Q5T742 122 aa5.79□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.79□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 TOMM6Q96B49 74 aa5.79□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 SEC11CQ9BY50 192 aa5.79□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.79□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.79□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 ERASQ7Z444 233 aa5.78□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.78□□□□□ -1.48
ITGA3-213ENST00000512553 F8VRH5 84 aa5.77□□□□□ -1.49
ITGA3-213ENST00000512553 IGLV7-43P04211 117 aa5.77□□□□□ -1.49
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