RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 C1orf137Q5JT78 98 aa7.39□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 NRACQ8N912 160 aa7.39□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.39□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 TCAPO15273 167 aa7.38□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 SPAG11BQ08648 103 aa7.38□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.38□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 IMMP2LQ96T52 175 aa7.38□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00862A6NCI5 91 aa7.37□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 F8WDY8 70 aa7.37□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.37□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 DIRC1Q969H9 104 aa7.37□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 C20orf78Q9BR46 151 aa7.37□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.37□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 V9GYV3 84 aa7.37□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 CKS2P33552 79 aa7.36□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.36□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 Q6ZUT4 128 aa7.36□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 AKAP14Q86UN6 197 aa7.36□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.35□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 A0A087WZ39 114 aa7.35□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.35□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.35□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 A0A1B0GW15 77 aa7.34□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 NDUFA1O15239 70 aa7.34□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 IGLV7-43P04211 117 aa7.34□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 LCE1DQ5T752 114 aa7.34□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.34□□□□□ -1.23
CNOT4-211ENST00000498534 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.33□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.32□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 IFITM10A6NMD0 228 aa7.32□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 F8W036 122 aa7.32□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 TNFRSF6BO95407 300 aa7.32□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 S100A8P05109 93 aa7.32□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 HBBP68871 147 aa7.32□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 ADIRFQ15847 76 aa7.32□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.32□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.31□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.31□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 GAGE2EQ4V326 116 aa7.31□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.31□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.31□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.31□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 FAM168BA1KXE4 195 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 H0Y9J4 135 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 PPBPP02775 128 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 RAB5AP20339 215 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 C10orf25Q5T742 122 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 NAT8Q9UHE5 227 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.29□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 D6R8Y8 96 aa7.29□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 UBE2BP63146 152 aa7.29□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 FAM104AQ969W3 186 aa7.29□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.29□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.28□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.28□□□□□ -1.24
CNOT4-211ENST00000498534 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.27□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.27□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 NPYP01303 97 aa7.27□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 UBE2D1P51668 147 aa7.27□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 PEA15Q15121 130 aa7.27□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.27□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.27□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 LPAP08519 4548 aa7.26□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.26□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 M0QXV9 152 aa7.26□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 KIAA0087Q14695 138 aa7.26□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.26□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 ORMDL3Q8N138 153 aa7.26□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.25□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM141Q96I45 108 aa7.25□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 A0A1B0GXF2 115 aa7.24□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 C9JQL5 133 aa7.24□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 C2orf82Q6UX34 121 aa7.24□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.24□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.24□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 PRELID3AQ96N28 172 aa7.24□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.24□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.23□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 PRSS2P07478 247 aa7.23□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 CKS1BP61024 79 aa7.23□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 PRR4Q16378 134 aa7.23□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 Q6ZN92 141 aa7.23□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.23□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.22□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.22□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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