RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497977.1

PTPRN-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-218ENST00000497977 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRN-218ENST00000497977 WFDC2Q14508 124 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRN-218ENST00000497977 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRN-218ENST00000497977 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRN-218ENST00000497977 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRN-218ENST00000497977 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRN-218ENST00000497977 IFITM10A6NMD0 228 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRN-218ENST00000497977 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRN-218ENST00000497977 XGP55808 180 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRN-218ENST00000497977 LINC00310P59036 64 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRN-218ENST00000497977 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRN-218ENST00000497977 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRN-218ENST00000497977 TOMM6Q96B49 74 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRN-218ENST00000497977 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRN-218ENST00000497977 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRN-218ENST00000497977 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRN-218ENST00000497977 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRN-218ENST00000497977 A0A096LNJ9 63 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 LINC01546A6NGU7 62 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRN-218ENST00000497977 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 TMEM141Q96I45 108 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 VCX2Q9H322 139 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 H0Y8G0 127 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 NDUFA6P56556 154 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 FOXI1Q12951 378 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 NUPR1O60356 82 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 Q6ZSA8 131 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 TIMM17AQ99595 171 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 IGIPA6NJ69 53 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 FABP4P15090 132 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 ERASQ7Z444 233 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 FAM104AQ969W3 186 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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PTPRN-218ENST00000497977 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 ATP5LO75964 103 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 LEPROTL1O95214 131 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 LINC01620Q4KN68 170 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 Q5VSD8 79 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRN-218ENST00000497977 C2orf48Q96LS8 159 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTPRN-218ENST00000497977 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 C15orf56Q8N910 161 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 CARD19Q96LW7 228 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.71□□□□□ -1.34
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PTPRN-218ENST00000497977 A0A0J9YXV3 536 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRN-218ENST00000497977 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 PRSS2P07478 247 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 HERVK_113P63121 156 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRN-218ENST00000497977 RNF151Q2KHN1 245 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 C7orf33Q8WU49 177 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRN-218ENST00000497977 SLPIP03973 132 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 SPAG11BQ08648 103 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 CST9LQ9H4G1 147 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 S100A2P29034 98 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 MAJINQ3KP22 176 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 KRTDAPP60985 99 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 CKS1BP61024 79 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRN-218ENST00000497977 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.66□□□□□ -1.34
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