RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493208.1

IRF1-210, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IRF1, Length 1,023 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-210ENST00000493208 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.62□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 UQCC3Q6UW78 93 aa8.62□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 IMMP2LQ96T52 175 aa8.62□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.62□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 A0A096LNI7 61 aa8.61□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 RNF151Q2KHN1 245 aa8.61□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 CLLU1Q5K131 121 aa8.61□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.61□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 C5orf38Q86SI9 138 aa8.61□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.61□□□□□ -1.03
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IRF1-210ENST00000493208 PTTG1IPP53801 180 aa8.6□□□□□ -1.03
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IRF1-210ENST00000493208 SEC11AP67812 179 aa8.59□□□□□ -1.03
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IRF1-210ENST00000493208 Q6ZRP5 223 aa8.59□□□□□ -1.03
IRF1-210ENST00000493208 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.59□□□□□ -1.03
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IRF1-210ENST00000493208 REG3GQ6UW15 175 aa8.58□□□□□ -1.04
IRF1-210ENST00000493208 Q8N8P6 123 aa8.58□□□□□ -1.04
IRF1-210ENST00000493208 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
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IRF1-210ENST00000493208 VCX2Q9H322 139 aa8.57□□□□□ -1.04
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IRF1-210ENST00000493208 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
IRF1-210ENST00000493208 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.56□□□□□ -1.04
IRF1-210ENST00000493208 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.55□□□□□ -1.04
IRF1-210ENST00000493208 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.55□□□□□ -1.04
IRF1-210ENST00000493208 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
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IRF1-210ENST00000493208 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
IRF1-210ENST00000493208 MT-ND6P03923 174 aa8.52□□□□□ -1.05
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IRF1-210ENST00000493208 HERVK_113P63121 156 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF1-210ENST00000493208 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
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IRF1-210ENST00000493208 TOMM6Q96B49 74 aa8.47□□□□□ -1.05
IRF1-210ENST00000493208 LINC01600Q96MT4 127 aa8.47□□□□□ -1.05
IRF1-210ENST00000493208 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.47□□□□□ -1.05
IRF1-210ENST00000493208 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.47□□□□□ -1.05
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IRF1-210ENST00000493208 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.46□□□□□ -1.06
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IRF1-210ENST00000493208 COMMD7Q86VX2 200 aa8.46□□□□□ -1.06
IRF1-210ENST00000493208 Q8IZM0 81 aa8.46□□□□□ -1.06
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IRF1-210ENST00000493208 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.45□□□□□ -1.06
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IRF1-210ENST00000493208 F8VRH5 84 aa8.43□□□□□ -1.06
IRF1-210ENST00000493208 H3BRM9 83 aa8.43□□□□□ -1.06
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IRF1-210ENST00000493208 KIAA0087Q14695 138 aa8.43□□□□□ -1.06
IRF1-210ENST00000493208 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.43□□□□□ -1.06
IRF1-210ENST00000493208 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
IRF1-210ENST00000493208 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.43□□□□□ -1.06
IRF1-210ENST00000493208 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.43□□□□□ -1.06
IRF1-210ENST00000493208 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.43□□□□□ -1.06
IRF1-210ENST00000493208 M0QXV9 152 aa8.42□□□□□ -1.06
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