RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	FABP4	P15090	132 aa		3.87	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	PYY3	Q5JQD4	70 aa		3.87	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		3.87	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		3.87	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		3.87	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		3.87	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	TIMM17A	Q99595	171 aa		3.87	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	KIR2DL4	Q99706	377 aa		3.87	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		3.87	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		3.86	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		3.86	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		3.86	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		3.86	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717		E9PLD3	99 aa		3.86	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717		H7C423	109 aa		3.86	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	C3orf79	P0CE67	100 aa		3.86	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC01545	Q5VT33	79 aa		3.86	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		3.86	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	AMELX	Q99217	191 aa		3.86	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		3.86	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		3.86	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		3.85	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		3.85	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717		F5H768	121 aa		3.85	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		3.85	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	LEPROTL1	O95214	131 aa		3.85	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	COTL1	Q14019	142 aa		3.85	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		3.85	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		3.85	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		3.85	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		3.85	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		3.85	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		3.85	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	APLN	Q9ULZ1	77 aa		3.85	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		3.85	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		3.84	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	SMIM6	P0DI80	62 aa		3.84	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	G0S2	P27469	103 aa		3.84	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	S100A2	P29034	98 aa		3.84	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	LELP1	Q5T871	98 aa		3.84	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		3.84	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	BAALC	Q8WXS3	180 aa		3.84	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		3.84	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM141	Q96I45	108 aa		3.84	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		3.84	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		3.84	□□□□□ -1.79
DCTN1-222	ENST00000492717	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		3.83	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		3.83	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A0J9YY99	117 aa		3.83	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	CFC1B	P0CG36	223 aa		3.83	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	CFC1	P0CG37	223 aa		3.83	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	LCE1D	Q5T752	114 aa		3.83	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		3.83	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717		Q6ZUT4	128 aa		3.83	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		3.83	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	UPK3B	Q9BT76	320 aa		3.83	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM243	Q9BU79	118 aa		3.83	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		3.83	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		3.82	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A087WX48	190 aa		3.82	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	LY6G6C	O95867	125 aa		3.82	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	IGLC3	P0DOY3	106 aa		3.82	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	FGF6	P10767	208 aa		3.82	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	ESRG	Q1W209	222 aa		3.82	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		3.82	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	CST9L	Q9H4G1	147 aa		3.82	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	PRR34	Q9NV39	138 aa		3.82	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		3.82	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.81	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717		F8VRH5	84 aa		3.81	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		3.81	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	HTN3	P15516	51 aa		3.81	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	UBE2D1	P51668	147 aa		3.81	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	RBX1	P62877	108 aa		3.81	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	PMVK	Q15126	192 aa		3.81	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	MPV17L2	Q567V2	206 aa		3.81	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	REG3G	Q6UW15	175 aa		3.81	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		3.81	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	IGLL5	B9A064	214 aa		3.8	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	KRTDAP	P60985	99 aa		3.8	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		3.8	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		3.8	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		3.8	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		3.8	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		3.8	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		3.8	□□□□□ -1.8

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