RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	XCL1	P47992	114 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292		Q6ZTI0	123 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	RNF152	Q8N8N0	203 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	HAMP	P81172	84 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	COX7C	P15954	63 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM86B	Q8N661	226 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	COX7B2	Q8TF08	81 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A087WYN8	130 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	IGLV1-40	P01703	118 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ERCC3-208	ENST00000491292	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		7.09	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	PSMB8	P28062	276 aa		7.09	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	C20orf197	Q8N268	126 aa		7.09	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		7.09	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		7.09	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	IMUP	Q9GZP8	106 aa		7.09	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292		K7EQD1	137 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	USP17L23	D6RBM5	183 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	GHRH	P01286	108 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	TIMM17B	O60830	172 aa		7.07	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	ITPR1	Q14643	2758 aa		7.07	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	ESM1	Q9NQ30	184 aa		7.07	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC00846	Q9NV44	126 aa		7.07	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	HTN3	P15516	51 aa		7.07	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	CXCL5	P42830	114 aa		7.07	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		7.07	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	HILS1	P60008	231 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	ENHO	Q6UWT2	76 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	UBL5	Q9BZL1	73 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	PLA2G2A	P14555	144 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	C5orf47	Q569G3	176 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	CHD6	Q8TD26	2715 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292		H0YGX0	51 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	CCL18	P55774	89 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	BRI3	O95415	125 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	SERP2	Q8N6R1	65 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	ZAN	Q9Y493	2812 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM89	A2RUT3	159 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	SCX	Q7RTU7	201 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	SS18	Q15532	418 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	F8	P00451	2351 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM104A	Q969W3	186 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292		Q96MF0	132 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	SNURF	Q9Y675	71 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	PF4	P02776	101 aa		7	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	C4orf26	Q17RF5	130 aa		7	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	UPK3B	Q9BT76	320 aa		7	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	DEFB4A	O15263	64 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292		A8MTW9	85 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	FLNC	Q14315	2725 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	GYPE	P15421	78 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	KLK9	Q2XQG4	91 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ERCC3-208	ENST00000491292	C6orf99	Q4VX62	202 aa		6.98	□□□□□ -1.29

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