RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 ZFHX3Q15911 3703 aa-0.84□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-0.85□□□□□ -2.54
ITGA4-211ENST00000490435 HAMPP81172 84 aa-0.85□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-0.85□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 ERCC6L2Q5T890 1561 aa-0.85□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-0.85□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 DPH3Q96FX2 82 aa-0.85□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-0.85□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-0.86□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 NBASA2RRP1 2371 aa-0.86□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 SMIM4Q8WVI0 70 aa-0.86□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 TCEAL4Q96EI5 215 aa-0.86□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 ACACBO00763 2458 aa-0.86□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 CHD7Q9P2D1 2997 aa-0.86□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 UNC13AQ9UPW8 1703 aa-0.86□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 SBF2Q86WG5 1849 aa-0.87□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-0.87□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 MT1GP13640 62 aa-0.87□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 SMCO1Q147U7 214 aa-0.87□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 MT1MQ8N339 61 aa-0.87□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 SPTA1P02549 2419 aa-0.87□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 ITPR1Q14643 2758 aa-0.88□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.88□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 KALRNO60229 2985 aa-0.88□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 MT2AP02795 61 aa-0.88□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 MAFIPQ8WZ33 124 aa-0.88□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 AMELXQ99217 191 aa-0.88□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 LENEPQ9Y5L5 61 aa-0.88□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 GRIN2AQ12879 1464 aa-0.88□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 ACACAQ13085 2346 aa-0.88□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 PAPPAQ13219 1627 aa-0.89□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 TSC2P49815 1807 aa-0.89□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-0.89□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-0.89□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 DEFA5Q01523 94 aa-0.89□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 C10orf128Q5T292 105 aa-0.89□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 LINC00472Q9H8W2 130 aa-0.89□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 CCDC167Q9P0B6 97 aa-0.89□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 FAM186AA6NE01 2351 aa-0.9□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-0.9□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-0.9□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 H0YAA0 97 aa-0.9□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 SPAG11AQ6PDA7 123 aa-0.9□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 AQP10Q96PS8 301 aa-0.9□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 HTTP42858 3142 aa-0.9□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 CEP295Q9C0D2 2601 aa-0.9□□□□□ -2.55
ITGA4-211ENST00000490435 REV3LO60673 3130 aa-0.91□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 MT1EP04732 61 aa-0.91□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 S100A3P33764 101 aa-0.91□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 DCDP81605 110 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 Q8N8P6 123 aa-0.91□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-0.92□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 TTC9CQ8N5M4 171 aa-0.92□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 MT1LQ93083 61 aa-0.92□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 V9GYH0 126 aa-0.92□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 TRIOO75962 3097 aa-0.92□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 CSMD2Q7Z408 3487 aa-0.92□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-0.92□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 BICRAQ9NZM4 1560 aa-0.92□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 CFTRP13569 1480 aa-0.92□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa-0.93□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 K7EQZ3 153 aa-0.93□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-0.93□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa-0.94□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-0.94□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 PDCD10Q9BUL8 212 aa-0.94□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 NBEAQ8NFP9 2946 aa-0.94□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 C5orf42Q9H799 3197 aa-0.95□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-0.95□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 ITPR2Q14571 2701 aa-0.95□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 M0R2T5 61 aa-0.95□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 COX17Q14061 63 aa-0.95□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 C12orf73Q69YU5 71 aa-0.95□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 Q6JHZ5 121 aa-0.95□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-0.95□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 PHLPP1O60346 1717 aa-0.95□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 MYH7P12883 1935 aa-0.95□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 MYO9AB2RTY4 2548 aa-0.95□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 PSME4Q14997 1843 aa-0.96□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 FOCADQ5VW36 1801 aa-0.96□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-0.96□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 ARPC4P59998 168 aa-0.96□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 PIGYQ3MUY2 71 aa-0.96□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 Q6AWC8 147 aa-0.96□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 PFDN5Q99471 154 aa-0.96□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa-0.96□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-0.97□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 KNL1Q8NG31 2342 aa-0.97□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 MT1FP04733 61 aa-0.97□□□□□ -2.56
ITGA4-211ENST00000490435 RERGLQ9H628 205 aa-0.97□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms